Проведен анализ и обобщены сведения о механизмах резистентности к антимикробным препаратам у бактерий. Рассмотрены основные причины возникновения и распространения устойчивости у бактерий. Охарактеризовано действие механизмов естественной резистентности патогенных бактерий (неспецифические эффлюксные насосы, инактивирующие антибиотики ферменты и механизмы, которые служат барьерами проницаемости). Описаны механизмы приобретенной устойчивости: модификация или разложение антибиотика; активное выведение антимикробного препарата из бактериальной клетки – эффлюкс (отток), секвестрация, модификация мишени (байпас). Показана дискуссионность вопроса о происхождении механизмов устойчивости к антибиотикам у патогенных бактерий. Отмечено, что прямая передача генов устойчивости к антимикробным препаратам может происходить от микроорганизмов-продуцентов к патогенным бактериям, но достоверная связь между этим процессом и распространением антимикробной резистентности в настоящее время не выявлена и не доказана. Роль горизонтальной передачи генов, включающей трансформацию свободной ДНК, трансдукцию бактериофагами и конъюгацию с участием плазмид, считают важной в распространении антимикробной резистентности. Все три механизма широко распространены в природе, хотя некоторые виды бактерий используют один механизм в большей степени, чем два других. Полагают, что трансдукция играет важную роль, в частности, в переносе генов устойчивости к антибиотикам, но до настоящего времени нет ясности в вопросе о значении трансформации или трансдукции в переносе генов резистентности в условиях лаборатории или в окружающей среде из-за сложности обнаружения рекомбинаций, возникших в естественных условиях. Представлены данные о роли коньюгации в распространении генов антимикробной резистентности в природе, в частности генов устойчивости к карбапенемам и хинолонам у грамотрицательных и грамположительных бактерий. Отмечены новые тенденции в распространении генов антимикробной резистентности. 

Представлены данные о фенотипической и генотипической характеристике антибиотикорезистентности клинических изолятов Escherichia coli, выделенных из микробных биотопов (секрет молочной железы, цервикальные смывы) крупного рогатого скота. Исследовано 127 изолятов кишечной палочки, в том числе 44 – из секрета молочной железы, 83 – из цервикальных смывов. Антибиотикорезистентность культур изучали диско-диффузионным методом, минимальные ингибирующие концентрации антибактериальных препаратов определяли методом серийных разведений, гены резистентности детектировали с помощью полимеразной цепной реакции. В результате исследований показано широкое распространение изолятов микроорганизмов с фенотипом резистентности к ансамицинам (рифампицину), полусинтетическим пенициллинам (ампициллину и амоксициллину), тетрациклинам (доксициклину). Меньший уровень устойчивости изоляты проявляли к макролидам (азитромицину), амфениколам (левомицетину) и аминогликозидам (тобрамицину). Установлено, что клинические изоляты Escherichia coli чувствительны к цефалоспоринам III поколения и противомикробным средствам из группы фторхинолонов. Однако регистрация у 28,46% культур промежуточной резистентности к цефалоспоринам III поколения и выявление гена blaDHA, ассоциированного с развитием устойчивости к данной группе препаратов в 49,02% образцов ДНК эшерихий, изолированных из секрета молочной железы, не позволяют рекомендовать их в качестве препаратов выбора. Отсутствие гена VIM, кодирующего продукцию карбапенемаз в ДНК у выделенных изолятов, и низкий уровень фенотипической устойчивости (10,22% изолятов из цервикальных смывов) может служить одной из предпосылок для рекомендации использования карбапенемов 1-го ряда в качестве препаратов выбора для терапии заболеваний животных, ассоциированных с Escherichia coli, наряду со фторхинолонами, однако только в качестве препаратов резерва. Установлено, что выделенные изоляты Escherichia coli демонстрировали большую чувствительность к комбинированным противомикробным лекарственным средствам в сравнении с монопрепаратами. 

Широкое применение антимикотических средств для терапии микозов у человека и животных вызывает беспокойство медицинских и ветеринарных специалистов в связи с возникновением резистентности патогенных и условно-патогенных грибов к противогрибковым препаратам. За последние годы накоплена информация о различных молекулярных механизмах, лежащих в основе данного явления, однако для успешного прогнозирования резистентности в различных группах грибов необходимо провести углубленные исследования. Для терапии и профилактики грибковых заболеваний активно применяют несколько групп препаратов, среди которых наиболее часто используют азолы и аллиламины, что приводит к накоплению резистентности патогенных и условно-патогенных грибов к этим противогрибковым средствам. В работе представлены результаты использования молекулярно-генетических методов для выявления устойчивых к азолам изолятов Candida albicans и устойчивых к тербинафину изолятов грибов рода Trichophyton. Анализ нуклеотидных последовательностей гена ERG11 10 изолятов Candida albicans, выделенных от разных видов животных, позволил разделить фенотипически устойчивые и чувствительные штаммы, однако не дал возможности дифференцировать штаммы, обладающие дозозависимой устойчивостью к азолам. Изучение однонуклеотидных полиморфизмов в гене SQLE, ассоциированном с развитием устойчивости к тербинафину, у 12 изолятов грибов рода Trichophyton не позволило разделить их по резистентности, что, вероятно, связано с действием другого механизма устойчивости, который может наблюдаться у данных штаммов. Полученные результаты исследований служат основанием для использования молекулярно-генетических методов для характеристики грибов рода Candida и Trichophyton, однако, с учетом биологических особенностей патогенов разных групп, для прогнозирования резистентности целесообразно использовать несколько значимых участков генома или результаты полногеномного секвенирования, а также анализ экспрессии генов. 

Представлены результаты изучения антибиотикорезистентности изолятов сальмонелл, полученных при исследовании образцов продуктов животноводства в лаборатории микробиологических исследований ФГБУ «ВНИИЗЖ» за период с 2019 по 2020 г. При испытании 4500 проб сырья и продукции животного происхождения было выделено 106 изолятов бактерий Salmonella entericasubsp. enterica, из которых 23% были нетипируемыми, а 77% принадлежали к 17 серологическим вариантам. Среди типированных культур сальмонелл доминировали изоляты серовариантов S. enteritidis (n = 37) и S. virchow (n = 9), что согласуется с данными других авторов. Чувствительность микроорганизмов к антибактериальным препаратам определяли диско-диффузионным методом, в соответствии с рекомендациями European Committeeon Antimicrobial Susceptibility Testing. Были выявлены различия в соотношении чувствительных и резистентных изолятов бактерий рода Salmonella разных серологических вариантов по отношению к антибиотикам десяти фармакологических групп. Наибольшее число полирезистентных изолятов отмечали у сальмонелл сероваров S. virchow, S. nigeria, S. infantis, S. colindale. Резистентные и полирезистентные изоляты сальмонелл наиболее часто выделяли из продукции птицеводства. Серовар S. typhimurium, который в источниках литературы определяют как полирезистентный, в представленных исследованиях был устойчив к одному или двум антимикробным препаратам. У изолятов 9 сероваров сальмонелл из 17 (65%) отмечена устойчивость к налидиксовой кислоте. Доля резистентных к данному средству изолятов S. enteritidis составила 97% (n = 36). Изоляты серовара S. colindale (n = 2) были устойчивы к 8 антимикробным препаратам, S. papuana (n = 5) – к 6 антибиотикам, а S. agona (n = 3) – к 5 антибактериальным средствам. Нетипируемые изоляты сальмонелл были резистентны к 9 антибиотикам, из которых 2 культуры проявили устойчивость к ципрофлоксацину. 

Настоящее исследование посвящено изучению влияния условий культивирования на рост и формирование биопленок культурой Pseudomonas aeruginosa. В связи с высокой частотой встречаемости инфекционных заболеваний, вызванных P. aeruginosa, а также устойчивостью синегнойной палочки, в особенности из-за способности образовывать биопленки, данная тема не теряет актуальности. В работе проанализировали влияние на феномен биопленкообразования таких характеристик, как используемая для посева фаза роста культуры (логарифмическая, стационарная), объем среды для выращивания (0,2 и 1,0 мл) и концентрация питательных веществ (жидкие питательные среды, разведенные до концентраций 50; 25; 12,5 и 6%) в объеме культивирования. Проведенные исследования показали, что на образование биопленок оказывает влияние совокупность всех перечисленных параметров. Установлено, что определяющим фактором в формировании биопленок являлась фаза роста бактерий, в которой функционировала культура синегнойной палочки перед инокуляцией. При посеве P. aeruginosa, пребывающей в стационарной фазе роста, образование биопленок нелинейно зависело от концентрации питательных веществ и общего их количества в объеме культивирования. Линейная зависимость образования биопленок от концентрации питательных веществ в среде культивирования была более выражена при посеве P. aeruginosa, находящейся в фазе логарифмического роста. Установлено, что при меньших концентрациях компонентов питательных сред различия в образовании биопленок были более заметны и имели статистическую значимость. Разбавление жидкой питательной среды в 2 раза не влияло на интенсивность формирования пленки, в то время как 4−8-кратное снижение концентрации питательных веществ в объеме культивирования 0,2 мл ингибировало образование биопленок. В объеме среды для культивирования, равном 1,0 мл, формирование биопленок было равномерным, а в объеме 0,2 мл статистически значимо снижалось при разведении питательной среды в 4 и 8 раз. Объем культивирования также имеет важное значение: так, выращенные в 0,2 мл питательной среды культуры при разных концентрациях питательных веществ формировали меньшее количество биопленок, чем микроорганизмы, культивируемые в объеме 1,0 мл. При этом при посеве P. aeruginosa, находящихся как в логарифмической, так и стационарной фазах роста, более выраженным было образование биопленок в лунках с большим объемом культивирования. 

Приведены данные по этиологической структуре потенциальных возбудителей пневмоний у обезьян согласно данным патолого-анатомической картины с последующими бактериологическими исследованиями тканей легких, взятых из морфологически измененных участков органа. В период с 2019 по 1-е полугодие 2021 г. от пневмоний погибло 377 животных. Наибольшая гибель от пневмоний отмечена у новорожденных (0–8 сут) и детенышей до 1 месяца (161 особь). В 94,4% случаев у погибших обезьян была выявлена полисегментарная бронхопневмония, доля крупозных пневмоний составила 4,5%. У детенышей пневмония чаще являлась единственным заболеванием. Микробный пейзаж при пневмониях обезьян отличался широким разнообразием. Из легочной ткани выделено 899 бактерий разных таксономических групп, из грамположительной микрофлоры преобладали стафилококки (23,8%), из грамотрицательной – Escherichiacoli (32,1%). Доля Streptococcus pneumoniae составила 0,3%. Удельный вес пневмоний неустановленной этиологии, по данным бактериологического исследования, был равен 0,7%. При исследовании образцов легочной ткани также выявлены бактериальные ассоциации, как правило, двух- и трехкомпонентные. Среди патогенов-ассоциантов чаще встречались следующие комбинации: Escherichiacoli+ Proteusspp. (24,7%), Staphylococcusaureus + Escherichiacoli (19,6%), Staphylococcus spp. + Enterococcus spp. + Escherichiacoli (35,5%), Staphylococcus spp. + Escherichiacoli + Proteus spp. (21,2%). Практически все выявленные энтеробактерии имеют высокий коэффициент ассоциативности, встречаясь в основном в виде ассоциаций. Анализ результатов исследования показал, что практически любой микроорганизм изолированно или в комбинации может привести к развитию пневмонии при ослаблении иммунитета животного, поэтому нельзя недооценивать влияние микрофлоры. Также возрастает роль микробов-ассоциантов в развитии пневмонии у обезьян, содержащихся в условиях неволи. 

Предложен новый способ послеубойной диагностики лейкоза крупного рогатого скота с применением реакции иммунной диффузии в геле агара. Предлагаемый метод позволяет выявлять антитела к антигену вируса лейкоза крупного рогатого скота, находящиеся в мышечно-тканевой жидкости (в плазме и лимфе) мяса и субпродуктов. Послеубойный отбор проб производили стерильным ватным тампоном путем смыва из разных частей туши и органов как заведомо серонегативных, так и не исследованных прижизненно животных. Полученные образцы биологического материала доставляли с сопроводительными документами в лабораторию. В пробирку со смывом добавляли от 0,5 до 0,7 мл изотонического раствора (0,85%-й раствор хлорида натрия) и оставляли на 3–5 ч для перехода в однородную субстанцию, выдерживали при температуре 18–26 °C и периодически встряхивали, чтобы антитела к вирусу лейкоза крупного рогатого скота со смыва переходили в физиологический раствор для дальнейшей постановки реакции иммунодиффузии. Учет результатов при проведении реакции проводили визуально путем выявления линий преципитации. При исследовании 175 образцов биологического материала от животных, не исследованных прижизненно на лейкоз крупного рогатого скота, серологическим методом положительный на лейкоз результат был получен в 5 (2,9%) случаях. При постановке реакции иммунодиффузии с пробами смывов с тканевой (лимфатической) жидкости, отобранными от 148 животных, которые на основании ветеринарных справок были прижизненно серонегативными к вирусу лейкоза крупного рогатого скота, получили отрицательные результаты. Таким образом, применение реакции иммунодиффузии может стать одним из способов послеубойной диагностики лейкоза крупного рогатого скота наряду с патолого-анатомическими, гистологическими, молекулярно-генетическими методами. 

Микробиом животных играет существенную роль во всех жизненно важных процессах организма. Его изучение необходимо для детального понимания процессов, происходящих между микроорганизмами, населяющими определенный орган, и их взаимосвязи с клетками макроорганизма. Оценка состояния микробного сообщества животных и его функции может оказать неоценимую помощь в поиске новых стратегий повышения эффективности кормления и сохранения здоровья крупного рогатого скота. Целью исследования было сравнение таксономической структуры микробиома кишечника крупного рогатого скота абердин-ангусской породы, импортированного в Казахстан, и коров местных пород с помощью технологии секвенирования нового поколения. Был определен полный микробный состав содержимого кишечника животных при исследовании образцов экскрементов без предварительной стадии микробиологического культивирования на питательных средах. Результаты 16S метагеномного анализа показали, что доминирующими бактериальными таксонами в микробиоме кишечника животных обеих групп на уровне типа были Firmicutes и Proteobacteria примерно в одинаковом количестве. На уровне бактериальных семейств численность представителей Clostridiaceae была немного больше у коров абердин-ангусской породы (19,7%), чем у скота местной породы (15,4%). Представители семейств Bacteroidaceae, Peptococcaceae, Ruminococcaceae и Coriobacteriaceae преобладали в микробном сообществе кишечника местного скота. Данные микроорганизмы участвуют в синтезе витаминов, стимулируют иммунную функцию организма, нормализуют пищеварение, увеличивают усвояемость питательных веществ и, как следствие, повышают привесы у животных. Бактерии семейства Prevotellaceae были выявлены в небольшом количестве (0,5%) только у коров местной породы, которые имели высокие привесы. На уровне рода значительное разнообразие наблюдали в микробиоме местного скота: всего 65 таксонов против 40 у абердин-ангусов. Установлено, что в кишечном микробиоме крупного рогатого скота местных пород содержится меньшее количество метаногенов и большее количество ацетогенов. 

Выполненное в 2016 г. моделирование потенциальных нозоареалов оспы овец и оспы коз до 2020 г. выявило возможность тренда на усугубление напряженности эпизоотической обстановки по этим болезням, но с учетом циклических колебаний ситуации допускалась возможность снижения напряженности в 2017–2020 гг. Наибольшая частота регистрации этих нозоединиц была характерна для регионов более высокой вероятности возникновения оспы овец и оспы коз. При ретроспективном анализе определены структура, динамика и особенности эпизоотического процесса данных инфекционных болезней в Республике Таджикистан в 2000–2021 гг. Выявлены основные причины возникновения вспышек оспы овец и оспы коз в стране. Полученные результаты, подтверждая методическую обоснованность осуществленного в 2016 г. анализа эпизоотической ситуации и верность разработанных моделей потенциальных нозоареалов оспы овец и оспы коз, могут стать основой для эпизоотологического прогнозирования риска возникновения инфекционных болезней при взаимодействии патогена с популяцией восприимчивых животных в конкретных климатогеографических, социально-экономических и организационно-хозяйственных условиях. При системном эпизоотологическом анализе структуры и динамики нозоареалов, результатов оценки риска заноса, возникновения и распространения, мониторинга и определения неблагополучных и эндемичных по оспе овец и оспе коз зон определены особенности и закономерности распространения и проявления эпизоотического процесса при этих заболеваниях, что подтверждает необходимость системного подхода к эпизоотологическому надзору за особо опасными и экономически значимыми инфекционными болезнями, имеющими тенденцию к трансграничному распространению, который будет способствовать решению проблемы определения возможных угроз и реализации ветеринарно-санитарных мероприятий в случае возникновения заболеваний на территории любой страны для сохранения эпизоотологического благополучия. 

Представлены данные по изучению параметров иммунного ответа цыплят после инфицирования изолятами низкопатогенного вируса гриппа птиц подтипа А/Н9N2, относящимися к генетическим линиям Y-280 и G1. Для первичного исследования иммунного статуса и выявления выраженных нарушений иммунной системы были определены соотношения CD4⁺/CD8⁺ клеток методом проточной цитофлуориметрии. В результате количественного анализа субпопуляций лимфоцитов периферической крови цыплят обнаружено наличие изменений, характерных для иммунной супрессии. При изучении динамики уровня Т- и В-лимфоцитов в крови инфицированных цыплят установлено снижение относительного количества Т-лимфоцитов и увеличение относительного количества В-лимфоцитов в крови. После инфицирования изменение субпопуляционного состава Т-лимфоцитов в процентном соотношении CD4⁺/CD8⁺ клеток отмечено в сторону уменьшения процента CD4⁺ клеток и увеличения процента CD8⁺ клеток. Согласно литературным данным, при иммунизации вакцинными препаратами активация иммунного ответа приводит к обратной динамике в сторону увеличения отношения CD4⁺/CD8⁺ клеток. В формировании иммунного ответа у цыплят после инфицирования вирусами гриппа птиц играет роль не только клеточно-опосредованный, но и гуморальный иммунитет. В результате серологических исследований сывороток крови цыплят после инфицирования на 14-е сут установлен выраженный гуморальный иммунный ответ. Средний титр специфических антител к вирусу гриппа птиц подтипа А/Н9N2 во всех группах цыплят, зараженных изолятами низкопатогенного вируса гриппа птиц, был выше 6 log₂. Высокий уровень специфических антител к вирусу гриппа птиц показал развитие постинфекционного гуморального иммунного ответа. 

Представлены результаты филогенетического анализа изолятов вируса инфекционной бурсальной болезни по нуклеотидным последовательностям фрагментов геномных сегментов А и В. Традиционно изоляты вируса инфекционной бурсальной болезни классифицируют на основе филогенетического анализа гипервариабельной области гена VP2. Анализ фрагмента гена VP2 изолятов, выявленных на территории Российской Федерации, показал, что большинство из них относятся к генетической группе, объединяющей высоковирулентные изоляты вируса инфекционной бурсальной болезни. Но не все изоляты, относящиеся к одной генетической группе, обладают одинаковыми фенотипическими свойствами. Это связано, в частности, и с тем, что вирулентность определяется генетическими особенностями не только гена VP2 (сегмент А), но и гена VP1 (сегмент В). Сегментированная природа генома вируса инфекционной бурсальной болезни делает возможным образование реассортантов, которые можно выявить в результате анализа обоих геномных сегментов. Филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей фрагментов генов VP2 и VP1 28 изолятов вируса инфекционной бурсальной болезни, выявленных в птицеводческих хозяйствах РФ, Украины и Казахстана в 2007–2019 гг., показал, что 15 из них являются реассортантами. Среди реассортантов выявлены различные комбинации геномных сегментов. Выявление разнообразия комбинаций геномных сегментов вируса инфекционной бурсальной болезни свидетельствует о том, что в птицеводческих хозяйствах циркулирует гетерогенная вирусная популяция. Изучение степени патогенности трех изолятов вируса инфекционной бурсальной болезни показало, что наиболее вирулентным был изолят, имеющий оба геномных сегмента, характерных для высоковирулентного вируса. Два реассортанта, имеющих только по одному геномному сегменту А или В, характерному для высоковирулентного вируса инфекционной бурсальной болезни, обладали менее выраженными вирулентными свойствами. 

В процессе содержания и разведения животных, а также при производстве, транспортировке, заготовке, переработке продуктов и сырья животного происхождения образуется значительное количество биологических отходов, которые являются источником загрязнения окружающей среды и создают реальную угрозу здоровью человека и животных. Установки по сжиганию биологических отходов животного происхождения являются объектами повышенной опасности и требуют постоянного наблюдения и надзора. Для объективного отражения реальной ситуации с объектами сжигания биологических отходов в субъектах Российской Федерации и формирования целостного представления о рассматриваемой проблеме в стране был проведен сбор информации и проанализированы данные, предоставленные органами исполнительной власти субъектов Российской Федерации в области ветеринарии. Рассмотрены такие показатели, как количество, вид (стационарные, мобильные), форма собственности, расположение, наличие сертификата и квалифицированных специалистов, обслуживающих установки для сжигания биологических отходов животного происхождения, а также обеспеченность субъектов Российской Федерации данными объектами по состоянию на 1 января 2021 г. Анализ полученных первичных данных показал, что в стране зарегистрировано 4459 объектов сжигания биологических отходов животного происхождения, основная часть которых составляет стационарные установки, находящиеся в ведении предприятий, занятых содержанием сельскохозяйственных животных, а также переработкой, производством и хранением животноводческой продукции. В большинстве случаев обслуживание данных объектов осуществляет неквалифицированный персонал, который не владеет знаниями о технических характеристиках и принципах работы используемых установок. Почти треть установок по сжиганию биологических отходов животного происхождения в стране непромышленного изготовления, поэтому их использование не гарантирует полного сгорания биологических отходов и инактивации патогенов. Также выявлено, что в стране законодательно не закреплен порядок проведения сжигания биологических отходов животного происхождения в трупосжигательных печах. Полученные результаты исследования свидетельствуют о том, что в Российской Федерации сложилась напряженная ситуация в сфере сжигания биологических отходов животного происхождения.