Идентификация Haemophilus parasuis с помощью метода MALDI-TOF масс-спектрометрии
Аннотация
В статье представлены результаты использования метода MALDI-TOF масс-спектрометрии для быстрой идентификации полевых изолятов Haemophilus parasuis. С помощью программы ClinProTools были выделены 15 пиков в белковом спектре со 100% распознавательной способностью, дифференцирующие 6 представителей Pasteurellaceae. Уникальным для Haemophilus parasuis является пик массой 8407,92 Да (р<0,05). Дополненная база данных успешно использована для идентификации 8 изолятов Haemophilus parasuis. При проверке специфичности метода с 9 видами бактерий семейства Pasteurellaceae ложноположительные результаты отсутствовали.
Об авторах
В. И. Павелко
ФГБУ «ВНИИЗЖ», г. Владимир
Россия
Россия
Ю. Ю. Бабин
ФГБУ «ВНИИЗЖ», г. Владимир
Россия
Россия
А. В. Пискунов
ФГБУ «ВНИИЗЖ», г. Владимир
Россия
Россия
А. В. Спрыгин
ФГБУ «ВНИИЗЖ», г. Владимир
Россия
Россия
О. В. Прунтова
ФГБУ «ВНИИЗЖ», г. Владимир
Россия
Россия
Список литературы
1. Identification of animal Pasteureilaceae by MALDI-TOF mass spectrometry / P. Kuhnert [et al.] // J. Microbiol. Methods. - 2012. - Vol. 89, № 1. - P. 1 -7.
2. Identification of Borrelia species after creation of an in-house MALDI-TOF MS database / A. Calderaro [et al.] // PLoS ONE. - 2014. - Vol. 9, № 2:e88895. - doi: 10.1371/journal.pone.0088895.
3. Microbial typing by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry: do we need guidance for data interpretation? / S. Spinali [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2015. - Vol. 53, № 3. - P. 760-765.
4. Olvera A., Segalés J., Aragon V. Update on the diagnosis of Haemophilus parasuis infection in pigs and novel genotyping methods // Vet. J. - 2007. - Vol. 174, № 3. - P. 522-529.
5. Pathologic observations of pigs intranasally inoculated with serovar 1,4and 5 of Haemophilus parasuis using immunoperoxidase method / H. Amano, M. Shibata, N. Kajio, T. Morozumi // J. Vet. Med. Sci. - 1994. - Vol. 56, № 4. - P. 639-644.
6. Phenotypic and genetic characterization of NAD-dependent Pasteureilaceae from the respiratory tract of pigs and their possible pathogenetic importance/ P. Kielstein [et al.] // Vet. Microbiol. - 2001. - Vol. 81, № 3,-P. 243-255.
7. Phylogenomic and molecular demarcation of the core members of the polyphyletic Pasteureilaceae genera Actinobacillus, Haemophilus, and Pasteureila / S. Naushad [et al.] // Int. J. Genomics. - 2015. - Vol. 2015. - URL: http://dx.doi.org/10.1155/2015/198560.
Для цитирования:
Павелко В.И., Бабин Ю.Ю., Пискунов А.В., Спрыгин А.В., Прунтова О.В. Идентификация Haemophilus parasuis с помощью метода MALDI-TOF масс-спектрометрии. Ветеринария сегодня. 2016;(2):61-65.
For citation:
Pavelko V.I., Babin Yu.Yu., Piskunov A.V., Sprygin A.V., Pruntova O.V. Identification of Haemophilus parasuis using MALDI-TOF mass spectrometry. Veterinary Science Today. 2016;(2):61-65. (In Russ.)
Просмотров: 216
Послать статью по эл. почте 