Внедрение технологии 454 Life Sciences в лабораторную практику

Показана возможность применения высокопроизводительного пирофосфатного секвенирования, также известного как технология 454 Life Sciences, для исследования высоковариабельных и малоизученных инфекционных агентов вирусной природы. Определены полногеномные нуклеотидные последовательности вирусов инфекционного бронхита кур, инфекционного ларинготрахеита, аденовируса птиц генотипа С и аденоассоциированного вируса птиц. Идентифицированы рекомбинации в геноме инфекционного бронхита кур, выявлены структурные и точечные мутации в геноме аденовируса птиц. Охарактеризована структура генома вируса инфекционного ларинготрахеита и аденоассоциированного вируса птиц.

инфекционный бронхит кур, инфекционный ларинготрахеит, аденовирус птиц, аденоассоциированный вирус птиц, геном, нуклеиновые кислоты, секвенирование, infectious bronchitis, infectious laryngotracheitis, fowl adenovirus, avian adeno-associated virus, genome, nucleic acids, sequencing

1. Генетический анализ изолята аденовируса птиц «Краснодар 2009»/ О.С. Осипова, Н.Г. Зиняков, И.А. Чвала, B.В. Дрыгин // Вестник ветеринарии. - 2014. - № 3. - C. 33-37.

2. Зиняков Н.Г. Выявление аденоассоциированных вирусов с помощью NGS-технологии // Молекулярная диагностика. - 2014. - Т. 2. - С. 448-449.

3. Овчинникова Е.В. Молекулярно-биологические свойства изолятов вируса инфекционного бронхита кур, выявленных на территории России в период с 2005 по 2011 гг.:дис.. канд. биол. наук. - Владимир, 2012.- 116с.

4. Adair В.М., Fitzgerald S.D. Group 1 adenovirus infections// Diseases of Poultry/ed.Y.M. Saif, A.M. Fadly, J.R. Glisson [et al.]. - 12th ed. - Ames, Iowa, - 2008. - P. 252-266.

5. Bossis I., Chiorini J.A. Cloning of an Avian Adeno-Associated Virus (AAAV) and Generation of Recombinant AAAV Particles / J. Vi roi. - 2003. - Vol. 77. - P. 6799-6810.

6. Knopf C.W., Spies В., Kaerner H.C. The DNA replication origins of herpes simplex virus type 1 strain Angelotti // Nucleic Acids Research.- 1986.-Vol. 14, № 21.- P. 8655-8667.

7. Metagenomic analysis of the viromes of three North American bat species: viral diversity among different bat species that share a common habitat / E.F. Donaldson, A.N. Haskew, J.E. Gates [et al.] // J. Virol. - 2010. - Vol. 84. - P. 13004-13018.

8. Sequencing viral genomes from a single isolated plaque/J. DePew, B. Zhou, J.M.McCorrison [etal.]//J.Virol.- 2013. - Vol. 10 (181 ). - doi: 10.1186/1743-422X-10-181.

9. Genetic analysis of fowl adenovirus isolate «Krasnodar 2009» / O. S. Osipova, N. G. Zinyakov, I. A.Chvala, V. V. Drygin//VestnikVeterinarii. -2014, -№3, -P. 33-37.

10. Zinyakov N. G. Detection of adeno-associated viruses using NGS-techniques//Molecular Diagnostics. - 2014.- Vol. 2, -P. 448-449.

11. Ovchinnikova Ye. V. Molecular and biological properties of IBV isolates detected in Russia in 2005-201Ί: thesis.. candidate of science (Biology).- Vladimir, 2012. -116 p.

12. Adair В. М., Fitzgerald S. D. Group 1 adenovirus infections // Diseases of Poultry / ed. Y. M. Saif, A. M. Fadly, J. R. Glisson [et al.].- 12th ed. - Ames, Iowa, - 2008.- P. 252-266.

13. Bossis I., Chiorini J. A. Cloning of an Avian Adeno-Associated Virus (AAAV) and Generation of Recombinant AAAV Pa rticles/J. Virol. - 2003,-Vol. 77. - P. 6799-6810.

14. Knopf C. W., Spies B., Kaerner H. C. The DNA replication origins of herpes simplex virus type 1 strain Angelotti // Nucleic Acids Research.- 1986.-Vol. 14, № 21.- P. 8655-8667.

15. Metagenomic analysis of the viromes of three North American bat species: viral diversity among different bat species that share a common habitat / E. F. Donaldson, A. N. Haskew, J. E. Gates [et al.] // J. Virol. - 2010.-Vol. 84. - P. 13004-13018.

16. Sequencing viral genomes from a single isolated plaque / J. DePew, B. Zhou, J. M. McCorrison [et al.] // J. Virol. - 2013. - Vol. 10 (181 ). - doi: 10.1186/1743-422X-10-181.