Внедрение технологии 454 Life Sciences в лабораторную практику

Полный текст:


Аннотация

Показана возможность применения высокопроизводительного пирофосфатного секвенирования, также известного как технология 454 Life Sciences, для исследования высоковариабельных и малоизученных инфекционных агентов вирусной природы. Определены полногеномные нуклеотидные последовательности вирусов инфекционного бронхита кур, инфекционного ларинготрахеита, аденовируса птиц генотипа С и аденоассоциированного вируса птиц. Идентифицированы рекомбинации в геноме инфекционного бронхита кур, выявлены структурные и точечные мутации в геноме аденовируса птиц. Охарактеризована структура генома вируса инфекционного ларинготрахеита и аденоассоциированного вируса птиц.

Об авторах

Н. Г. Зиняков
ФГБУ «ВНИИЗЖ», г. Владимир
Россия


Е. В. Овчинникова
ФГБУ «ВНИИЗЖ», г. Владимир
Россия


С. П. Лазарева
ФГБУ «ВНИИЗЖ», г. Владимир
Россия


А. А. Козлов
ФГБУ «ВНИИЗЖ», г. Владимир
Россия


И. А. Чвала
ФГБУ «ВНИИЗЖ», г. Владимир
Россия


Список литературы

1. Генетический анализ изолята аденовируса птиц «Краснодар 2009»/ О.С. Осипова, Н.Г. Зиняков, И.А. Чвала, B.В. Дрыгин // Вестник ветеринарии. - 2014. - № 3. - C. 33-37.

2. Зиняков Н.Г. Выявление аденоассоциированных вирусов с помощью NGS-технологии // Молекулярная диагностика. - 2014. - Т. 2. - С. 448-449.

3. Овчинникова Е.В. Молекулярно-биологические свойства изолятов вируса инфекционного бронхита кур, выявленных на территории России в период с 2005 по 2011 гг.:дис.. канд. биол. наук. - Владимир, 2012.- 116с.

4. Adair В.М., Fitzgerald S.D. Group 1 adenovirus infections// Diseases of Poultry/ed.Y.M. Saif, A.M. Fadly, J.R. Glisson [et al.]. - 12th ed. - Ames, Iowa, - 2008. - P. 252-266.

5. Bossis I., Chiorini J.A. Cloning of an Avian Adeno-Associated Virus (AAAV) and Generation of Recombinant AAAV Particles / J. Vi roi. - 2003. - Vol. 77. - P. 6799-6810.

6. Knopf C.W., Spies В., Kaerner H.C. The DNA replication origins of herpes simplex virus type 1 strain Angelotti // Nucleic Acids Research.- 1986.-Vol. 14, № 21.- P. 8655-8667.

7. Metagenomic analysis of the viromes of three North American bat species: viral diversity among different bat species that share a common habitat / E.F. Donaldson, A.N. Haskew, J.E. Gates [et al.] // J. Virol. - 2010. - Vol. 84. - P. 13004-13018.

8. Sequencing viral genomes from a single isolated plaque/J. DePew, B. Zhou, J.M.McCorrison [etal.]//J.Virol.- 2013. - Vol. 10 (181 ). - doi: 10.1186/1743-422X-10-181.

9. Genetic analysis of fowl adenovirus isolate «Krasnodar 2009» / O. S. Osipova, N. G. Zinyakov, I. A.Chvala, V. V. Drygin//VestnikVeterinarii. -2014, -№3, -P. 33-37.

10. Zinyakov N. G. Detection of adeno-associated viruses using NGS-techniques//Molecular Diagnostics. - 2014.- Vol. 2, -P. 448-449.

11. Ovchinnikova Ye. V. Molecular and biological properties of IBV isolates detected in Russia in 2005-201Ί: thesis.. candidate of science (Biology).- Vladimir, 2012. -116 p.

12. Adair В. М., Fitzgerald S. D. Group 1 adenovirus infections // Diseases of Poultry / ed. Y. M. Saif, A. M. Fadly, J. R. Glisson [et al.].- 12th ed. - Ames, Iowa, - 2008.- P. 252-266.

13. Bossis I., Chiorini J. A. Cloning of an Avian Adeno-Associated Virus (AAAV) and Generation of Recombinant AAAV Pa rticles/J. Virol. - 2003,-Vol. 77. - P. 6799-6810.

14. Knopf C. W., Spies B., Kaerner H. C. The DNA replication origins of herpes simplex virus type 1 strain Angelotti // Nucleic Acids Research.- 1986.-Vol. 14, № 21.- P. 8655-8667.

15. Metagenomic analysis of the viromes of three North American bat species: viral diversity among different bat species that share a common habitat / E. F. Donaldson, A. N. Haskew, J. E. Gates [et al.] // J. Virol. - 2010.-Vol. 84. - P. 13004-13018.

16. Sequencing viral genomes from a single isolated plaque / J. DePew, B. Zhou, J. M. McCorrison [et al.] // J. Virol. - 2013. - Vol. 10 (181 ). - doi: 10.1186/1743-422X-10-181.


Дополнительные файлы

Для цитирования: Зиняков Н.Г., Овчинникова Е.В., Лазарева С.П., Козлов А.А., Чвала И.А. Внедрение технологии 454 Life Sciences в лабораторную практику. Ветеринария сегодня. 2015;(1):36-40.

For citation: Zinyakov N.G., Ovchinnikova Y.V., Lazareva S.P., Kozlov A.A., Chvala I.A. Implementation of 454 Life Sciences technology laboratory practices. Veterinary Science Today. 2015;(1):36-40. (In Russ.)

Просмотров: 83

Обратные ссылки

  • Обратные ссылки не определены.


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2304-196X (Print)
ISSN 2658-6959 (Online)