veterinaryВетеринария сегодняVeterinary Science Today2304-196X2658-6959"Veinard"veterinary-176Research ArticleСтатьиВнедрение технологии 454 Life Sciences в лабораторную практикуImplementation of 454 Life Sciences technology laboratory practicesЗиняковН. Г.ZinyakovN. G.zinyakov@arriah.ruОвчинниковаЕ. В.OvchinnikovaYe. V.noemail@neicon.ruЛазареваС. П.LazarevaS. P.noemail@neicon.ruКозловА. А.KozlovA. A.noemail@neicon.ruЧвалаИ. А.ChvalaI. A.noemail@neicon.ruФГБУ «ВНИИЗЖ», г. ВладимирРоссияFGBI "ARRIAH", VladimirRussian Federation201502042018013640Copyright © Зиняков Н.Г., Овчинникова Е.В., Лазарева С.П., Козлов А.А., Чвала И.А., 20182018Зиняков Н.Г., Овчинникова Е.В., Лазарева С.П., Козлов А.А., Чвала И.А.Zinyakov N.G., Ovchinnikova Y.V., Lazareva S.P., Kozlov A.A., Chvala I.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://veterinary.arriah.ru/jour/article/view/176

Показана возможность применения высокопроизводительного пирофосфатного секвенирования, также известного как технология 454 Life Sciences, для исследования высоковариабельных и малоизученных инфекционных агентов вирусной природы. Определены полногеномные нуклеотидные последовательности вирусов инфекционного бронхита кур, инфекционного ларинготрахеита, аденовируса птиц генотипа С и аденоассоциированного вируса птиц. Идентифицированы рекомбинации в геноме инфекционного бронхита кур, выявлены структурные и точечные мутации в геноме аденовируса птиц. Охарактеризована структура генома вируса инфекционного ларинготрахеита и аденоассоциированного вируса птиц.

The article demonstrates possibility of using highly productive pyrophosphate sequencing, also known as 454 Life Sciences technology for investigation of highly variable and understudied infectious viral agents. Genome-wide nucleotide sequences of infectious bronchitis virus, infectious laryngotracheitis virus, fowl adenovirus C, and avian adenoassociated virus were determined. Recombinations in infectious bronchitis genome were identified, structural and point mutations in fowl adenovirus genome were detect

инфекционный бронхит куринфекционный ларинготрахеитаденовирус птицаденоассоциированный вирус птицгеномнуклеиновые кислотысеквенированиеinfectious bronchitisinfectious laryngotracheitisfowl adenovirusavian adeno-associated virusgenomenucleic acidssequencingReferencesГенетический анализ изолята аденовируса птиц «Краснодар 2009»/ О.С. Осипова, Н.Г. Зиняков, И.А. Чвала, B.В. Дрыгин // Вестник ветеринарии. - 2014. - № 3. - C. 33-37.Генетический анализ изолята аденовируса птиц «Краснодар 2009»/ О.С. Осипова, Н.Г. Зиняков, И.А. Чвала, B.В. Дрыгин // Вестник ветеринарии. - 2014. - № 3. - C. 33-37.Зиняков Н.Г. Выявление аденоассоциированных вирусов с помощью NGS-технологии // Молекулярная диагностика. - 2014. - Т. 2. - С. 448-449.Зиняков Н.Г. Выявление аденоассоциированных вирусов с помощью NGS-технологии // Молекулярная диагностика. - 2014. - Т. 2. - С. 448-449.Овчинникова Е.В. Молекулярно-биологические свойства изолятов вируса инфекционного бронхита кур, выявленных на территории России в период с 2005 по 2011 гг.:дис.. канд. биол. наук. - Владимир, 2012.- 116с.Овчинникова Е.В. Молекулярно-биологические свойства изолятов вируса инфекционного бронхита кур, выявленных на территории России в период с 2005 по 2011 гг.:дис.. канд. биол. наук. - Владимир, 2012.- 116с.Adair В.М., Fitzgerald S.D. Group 1 adenovirus infections// Diseases of Poultry/ed.Y.M. Saif, A.M. Fadly, J.R. Glisson [et al.]. - 12th ed. - Ames, Iowa, - 2008. - P. 252-266.Adair В.М., Fitzgerald S.D. Group 1 adenovirus infections// Diseases of Poultry/ed.Y.M. Saif, A.M. Fadly, J.R. Glisson [et al.]. - 12th ed. - Ames, Iowa, - 2008. - P. 252-266.Bossis I., Chiorini J.A. Cloning of an Avian Adeno-Associated Virus (AAAV) and Generation of Recombinant AAAV Particles / J. Vi roi. - 2003. - Vol. 77. - P. 6799-6810.Bossis I., Chiorini J.A. Cloning of an Avian Adeno-Associated Virus (AAAV) and Generation of Recombinant AAAV Particles / J. Vi roi. - 2003. - Vol. 77. - P. 6799-6810.Knopf C.W., Spies В., Kaerner H.C. The DNA replication origins of herpes simplex virus type 1 strain Angelotti // Nucleic Acids Research.- 1986.-Vol. 14, № 21.- P. 8655-8667.Knopf C.W., Spies В., Kaerner H.C. The DNA replication origins of herpes simplex virus type 1 strain Angelotti // Nucleic Acids Research.- 1986.-Vol. 14, № 21.- P. 8655-8667.Metagenomic analysis of the viromes of three North American bat species: viral diversity among different bat species that share a common habitat / E.F. Donaldson, A.N. Haskew, J.E. Gates [et al.] // J. Virol. - 2010. - Vol. 84. - P. 13004-13018.Metagenomic analysis of the viromes of three North American bat species: viral diversity among different bat species that share a common habitat / E.F. Donaldson, A.N. Haskew, J.E. Gates [et al.] // J. Virol. - 2010. - Vol. 84. - P. 13004-13018.Sequencing viral genomes from a single isolated plaque/J. DePew, B. Zhou, J.M.McCorrison [etal.]//J.Virol.- 2013. - Vol. 10 (181 ). - doi: 10.1186/1743-422X-10-181.Sequencing viral genomes from a single isolated plaque/J. DePew, B. Zhou, J.M.McCorrison [etal.]//J.Virol.- 2013. - Vol. 10 (181 ). - doi: 10.1186/1743-422X-10-181.Genetic analysis of fowl adenovirus isolate «Krasnodar 2009» / O. S. Osipova, N. G. Zinyakov, I. A.Chvala, V. V. Drygin//VestnikVeterinarii. -2014, -№3, -P. 33-37.Genetic analysis of fowl adenovirus isolate «Krasnodar 2009» / O. S. Osipova, N. G. Zinyakov, I. A.Chvala, V. V. Drygin//VestnikVeterinarii. -2014, -№3, -P. 33-37.Zinyakov N. G. Detection of adeno-associated viruses using NGS-techniques//Molecular Diagnostics. - 2014.- Vol. 2, -P. 448-449.Zinyakov N. G. Detection of adeno-associated viruses using NGS-techniques//Molecular Diagnostics. - 2014.- Vol. 2, -P. 448-449.Ovchinnikova Ye. V. Molecular and biological properties of IBV isolates detected in Russia in 2005-201Ί: thesis.. candidate of science (Biology).- Vladimir, 2012. -116 p.Ovchinnikova Ye. V. Molecular and biological properties of IBV isolates detected in Russia in 2005-201Ί: thesis.. candidate of science (Biology).- Vladimir, 2012. -116 p.Adair В. М., Fitzgerald S. D. Group 1 adenovirus infections // Diseases of Poultry / ed. Y. M. Saif, A. M. Fadly, J. R. Glisson [et al.].- 12th ed. - Ames, Iowa, - 2008.- P. 252-266.Adair В. М., Fitzgerald S. D. Group 1 adenovirus infections // Diseases of Poultry / ed. Y. M. Saif, A. M. Fadly, J. R. Glisson [et al.].- 12th ed. - Ames, Iowa, - 2008.- P. 252-266.Bossis I., Chiorini J. A. Cloning of an Avian Adeno-Associated Virus (AAAV) and Generation of Recombinant AAAV Pa rticles/J. Virol. - 2003,-Vol. 77. - P. 6799-6810.Bossis I., Chiorini J. A. Cloning of an Avian Adeno-Associated Virus (AAAV) and Generation of Recombinant AAAV Pa rticles/J. Virol. - 2003,-Vol. 77. - P. 6799-6810.Knopf C. W., Spies B., Kaerner H. C. The DNA replication origins of herpes simplex virus type 1 strain Angelotti // Nucleic Acids Research.- 1986.-Vol. 14, № 21.- P. 8655-8667.Knopf C. W., Spies B., Kaerner H. C. The DNA replication origins of herpes simplex virus type 1 strain Angelotti // Nucleic Acids Research.- 1986.-Vol. 14, № 21.- P. 8655-8667.Metagenomic analysis of the viromes of three North American bat species: viral diversity among different bat species that share a common habitat / E. F. Donaldson, A. N. Haskew, J. E. Gates [et al.] // J. Virol. - 2010.-Vol. 84. - P. 13004-13018.Metagenomic analysis of the viromes of three North American bat species: viral diversity among different bat species that share a common habitat / E. F. Donaldson, A. N. Haskew, J. E. Gates [et al.] // J. Virol. - 2010.-Vol. 84. - P. 13004-13018.Sequencing viral genomes from a single isolated plaque / J. DePew, B. Zhou, J. M. McCorrison [et al.] // J. Virol. - 2013. - Vol. 10 (181 ). - doi: 10.1186/1743-422X-10-181.Sequencing viral genomes from a single isolated plaque / J. DePew, B. Zhou, J. M. McCorrison [et al.] // J. Virol. - 2013. - Vol. 10 (181 ). - doi: 10.1186/1743-422X-10-181.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.