Молекулярная эпизоотология ящура в России (филогенетический анализ российских изолятов вируса ящура)

В статье обобщены результаты 20-летних молекулярно-эпизоотологических исследований ящура в России. Филогенетический анализ российских изолятов вируса ящура доказывает, что все вспышки ящура в Российской Федерации в 1995-2014 гг. были вызваны заносом болезни из других стран, главным образом из Китая. Показано, что в разные годы происходил занос в Россию разных генетических линий/штаммов вируса ящура: 1995 г. - 0/САТН AY, 2000 и 2004 гг. - O/ME-SA/PanAsia, 2005-2006 гг. - Asial, 2010-2011 гг. - O/SEA/Mea-98,2012 г.- О/ME-SA/ PanAsia, 2013 г. - A/ASIA/lran-05 и A/ASIA/Sea-97,2014 г. - A/ASIA/Sea-97, O/ME-SA/PanAsia и O/SEA/Mea-98. Большинство вспышек, зарегистрированных в Забайкалье и на Дальнем Востоке Российской Федерации, представляли собой продолжение панзоотий ящура, имеющих один и тот же путь распространения: из стран Юго-Восточной Азии в Китай и далее в Россию.

вирус ящура, филогенетический анализ, foot and mouth disease virus (FMDV), phylogenetic analysis

1. Молекулярная эпизоотология ящура в России и странах СНГ / A.B. Щербаков, В.Г. Андреев, В.В. Дрыгин, A.A. Гусев // Аграрная Россия. - 2002 - № 2. - С. 8-11.

2. Филогенетический анализ российских изолятов вируса ящура / A.B. Щербаков, А.М. Тимина, A.C. Яковлева, В.В. Дрыгин, В.М. Захаров // Тр. Федерального центра охраны здоровья животных. - Владимир, 2006. - Т. 4. - С. 20-25.

3. Щербаков A.B., Перевозчикова H.A., Дрыгин В.В. Методические указания по индикации генома и штаммовой дифференциации вируса ящура методом полимеразной цепной реакции и секвенированием гена VP1 // Методические указания по диагностике заболеваний сельскохозяйственных животных методом полимеразной цепной реакции. - Владимир, Ί 998. - С. 31-41.

4. Щербаков A.B., Тимина А.М. Филогенетический анализ изолятов вируса ящура, вызвавших вспышки болезни в России и Монголии в 2010 г.//Тр. Федерального центра охраны здоровья животных. - Владимир, 2011, -Т. 9, -С. 5-11.

5. Щербаков A.B., Тимина А.М., Зиняков Н.Г. Филогенетический анализ изолятов вируса ящура, вызвавших вспышки болезни в России в 2013 году// Ветеринария. - 2014. - № 7. - С. 22-25.

6. Эпизоотическая ситуация по ящуру типа Азия-1 в России в 2005 году и анализ эффективности мер борьбы / К.Н. Груздев, Т.З. Байбиков, В.Н. Герасимов [и др.] // Тр. Федерального центра охраны здоровья животных. - Владимир, 2006. - Т. 4. - С. 3-19.

7. Application of RT-PCR and nucleotide sequencing in foot-and-mouth disease diagnosis / A. Sherbakov, N. Lomakina, V. Drygin, A. Gusev //The Veterinary Quarterly. - 1998. - Vol. 20, № 2. - P. 32-34.

8. Beard C.W., Mason P.W. Genetic determinants of altered virulence ofTaiwanese foot-and-mouth disease virus // J. Virol. - 2000 - Vol. 74, № 2. - P. 987-991.

9. Beck E., Strohmaier К. Subtyping of european foot-and-mouth disease virus strains by nucleotide sequence determination //J.Virol. - 1987. - Vol. 61. - P. 1621-1629.

10. Comparative sequence analysis of representative foot-and-mouth disease virus genomes from Southeast Asia / N.F. Abdul-Hamid, M. Firat-Saraç, A.D. Radford [et al.] // Virus Genes. - 2011. - Vol. 43, №1, -P. 41-45.

11. Emergence of a pandemic strain of foot-and-mouth disease virus serotype О / N.J. Knowles, A.R. Samuel, P.R. Davies [et al.] // European Commission for the control of FMD. Session of the Research Group of the Standing Technical Committee Borovets, Bulgaria, 5-8 September, 2000. - P. 20-31.

12. Genetic basis of antigenic variation in foot-and-mouth disease serotype A viruses from the Middle East / S. Upadhyaya, G. Ayelet, G. Paul [et al.] // Vaccine. - 2014, - Vol. 32, № 5. - P. 631-638.

13. Knowles N.J., Samuel A.R. Molecular epidemiology of foot-and-mouth disease virus //Virus Res. - 2003. - Vol. 91, № 1, -P. 65-80.

14. Preliminary molecular analysis of FMD virus isolates collected on territories of Russia and the CIS in 1993-1994 / V.V. Drygin, A.V. Scherbakov, N.A. Perevozchikova, A.A. Gusev// Europ. Commiss. FMD. Vienna. Austria, 19-22 September 1994. - Rome, 1994. - P. 8.

15. Recent spread of a new strain (A-lran-05) of foot-and-mouth disease virus type A in the Middle East / N.J. Knowles, M.H. Nazem Shirazi, J. Wadsworth [et al.] // Transbound Emerg Dis. - 2009.-Vol. 56, №5. -P. 157- 169.

16. Recent spread of FMD virus serotype Asia 1 / J.F. Valarcher, N.J. Knowles, N.P. Ferris [et al.] // Vet. Record. - 2005. - July 2. - P. 30.

17. Samuel A.R., Knowles N.J. / Foot-and-mouth disease type О viruses exhibit genetically and geographically distinct evolutionary lineages (topotypes) //J. Gen. Virol. - 2001. - Vol. 82, № 3. - P. 609-621.

18. http://www.foot-and-mouth.org.

19. http://www.oie.int/wahis_2/public/wahid.php/ Diseaseinformation.

20. http://www.wrlfmd.org/fmd_genotyping.