Пространственно-временной анализ распространения африканской чумы свиней в популяции диких кабанов на территории Российской Федерации в 2007–2022 гг.
https://doi.org/10.29326/2304-196X-2023-12-1-57-65
Аннотация
Африканская чума свиней является трансграничной болезнью всех представителей семейства Suidae, приносящей экономический ущерб свиноводческой отрасли и экологии кабана как вида. Эпизоотология африканской чумы свиней сложна и определяется механизмами передачи возбудителя в популяциях восприимчивых животных. Выбор мер борьбы и предупреждения распространения заболевания в популяции кабанов зависит в основном от путей заноса, стадии или фазы эпизоотического процесса. Предотвращение заноса вируса африканской чумы свиней из неблагополучного региона в благополучный является основой профилактики инфекции. В связи с этим целью исследований явился пространственно-временной анализ очагов африканской чумы свиней в популяции кабанов в Российской Федерации в 2007–2022 гг. и обозначение географических территорий, представляющих риск возникновения новых эпизоотий. Анализ проведен с помощью ретроспективной статистики пространственно-временного сканирования, которая не требует данных о численности популяции кабана и которую можно использовать для оценки возможного возникновения новых очагов африканской чумы свиней, когда доступны только данные о зарегистрированных случаях или очагах болезни. При выполнении пространственно-временного кластерного анализа было выявлено 24 кластера очагов африканской чумы свиней, зарегистрированных на основании лабораторно подтвержденных данных об инфицировании кабанов, найденных мертвыми, и 22 кластера – кабанов, добытых на охоте. Результаты проведенного анализа продемонстрировали пространственную неоднородность распределения кластеров очагов инфекции в популяции кабанов, павших от болезни, а также существенное расширение географического охвата территории вследствие применения пассивного мониторинга. Показана важность и необходимость проведения усиленного пассивного мониторинга африканской чумы свиней среди восприимчивых животных. Предлагаемый метод можно использовать для регулярного сканирования географического региона на вероятность формирования зон и территорий риска новых вспышек африканской чумы свиней в популяции дикого кабана на территориях различного пространственного масштаба.
Ключевые слова
Об авторах
О. И. Захарова
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр вирусологии и микробиологии» (ФГБНУ ФИЦВиМ); Нижегородский научно-исследовательский ветеринарный институт – филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр вирусологии и микробиологии» (ННИВИ – филиал ФГБНУ ФИЦВиМ)
Россия
Россия
Захарова Ольга Игоревна, научный сотрудник отдела эпизоотологии и оценки риска, связанного со здоровьем животных
г. Нижний Новгород
А. А. Блохин
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр вирусологии и микробиологии» (ФГБНУ ФИЦВиМ); Нижегородский научно-исследовательский ветеринарный институт – филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр вирусологии и микробиологии» (ННИВИ – филиал ФГБНУ ФИЦВиМ)
Россия
Россия
Блохин Андрей Александрович, кандидат ветеринарных наук, ведущий научный сотрудник, руководитель отдела эпизоотологии и оценки риска, связанного со здоровьем животных
г. Нижний Новгород
О. А. Бурова
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр вирусологии и микробиологии» (ФГБНУ ФИЦВиМ); Нижегородский научно-исследовательский ветеринарный институт – филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр вирусологии и микробиологии» (ННИВИ – филиал ФГБНУ ФИЦВиМ)
Россия
Россия
Бурова Ольга Александровна, заместитель руководителя отдела эпизоотологии и оценки риска, связанного со здоровьем животных
г. Нижний Новгород
И. В. Яшин
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр вирусологии и микробиологии» (ФГБНУ ФИЦВиМ); Нижегородский научно-исследовательский ветеринарный институт – филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр вирусологии и микробиологии» (ННИВИ – филиал ФГБНУ ФИЦВиМ)
Россия
Россия
Яшин Иван Вячеславович, кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник отдела эпизоотологии и оценки риска, связанного со здоровьем животных
г. Нижний Новгород
Ф. И. Коренной
ФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных» (ФГБУ «ВНИИЗЖ»)
Россия
Россия
Коренной Федор Игоревич, кандидат географических наук, старший научный сотрудник информационно-аналитического центра
г. Владимир
Список литературы
1. De la Torre A., Bosch J., Sánchez-Vizcaíno J. M., Ito S., Muñoz C., IglesiasI., Martínez-Avilés M. African swine feversurvey in a European context. Pathogens. 2022; 11 (2):137. DOI: 10.3390/pathogens11020137.
2. EFSA, Baños J. V., Boklund A., Gogin A., Gortázar Ch., Guberti V., et al. Epidemiological analyses of African swine feverin the EuropeanUnion (September 2020 to August 2021). EFSA J. 2022; 20 (5):е07290. DOI: 10.2903/j. efsa.2022.7290.
3. Sauter-Louis C., Conraths F. J., Probst C., Blohm U., Schulz K., Sehl J., et al. African swine fever in wild boar in Europe – a review. Viruses. 2021; 13 (9):1717. DOI: 10.3390/v13091717.
4. Dixon L. K., Stahl K., Jori F., Vial L., Pfeiffer D. U. African swine fever epidemiology and control. Annu. Rev. Anim. Biosci. 2020; 8: 221–246. DOI: 10.1146/annurev-animal-021419-083741.
5. Pepin K. M., Golnar A. J., Abdo Z., Podgórski T. Ecological drivers of African swine fever virus persistence in wild boar populations: Insight for control. Ecol. Evol. 2020; 10 (6): 2846–2859. DOI: 10.1002/ece3.6100.
6. Arzumanyan H., Hakobyan S., Avagyan H., Izmailyan R., Nersisyan N., Karalyan Z. Possibility of long-term survival of African swine fever virus in natural conditions. Vet. World. 2021; 14 (4): 854–859. DOI: 10.14202/vetworld.2021.854-859.
7. Bergmann H., Schulz K., Conraths F. J., Sauter-Louis C. A review of environmental risk factors for African swine fever in European wild boar. Animals (Basel). 2021; 11 (9):2692. DOI: 10.3390/ani11092692.
8. Guinat C., Vergne T., Jurado-Diaz C., Sánchez-Vizcaíno J. M., Dixon L., Pfeiffer D. U. Effectiveness and practicality of control strategies for African swine fever: what do we really know? Vet. Rec. 2017; 180 (4):97. DOI: 10.1136/vr.103992.
9. Jori F., Bastos A. D. Role of wild suids in the epidemiology of African swine fever. Ecohealth. 2009; 6 (2): 296–310. DOI: 10.1007/s10393-009- 0248-7.
10. Jori F., Chenais E., Boinas F., Busauskas P., Dhollander S., Fleischmann L., et al. Application of the World Café method to discuss the efficiency of African swine fever control strategies in European wild boar (Sus scrofa) populations. Prev. Vet. Med. 2020; 185:105178. DOI: 10.1016/j. prevetmed.2020.105178.
11. Probst C., Globig A., Knoll B., Conraths F. J., Depner K. Behaviour of free ranging wild boartowardstheir dead fellows: potential implicationsfor the transmission of African swine fever. R. Soc. Open Sci. 2017; 4 (5):170054. DOI: 10.1098/rsos.170054. 12. Masiulis M., Bušauskas P., Jonušaitis V., Pridotkas G. Potential role of domestic pig carcasses disposed in the forest for the transmission of African swine fever. Berl. Münch. Tierärztl. Wochenschr. 2018; 131. DOI: 10.2376/0005-9366-18014.
12. Guberti V., Khomenko S., Masiulis M., Kerba S. African swine fever in wild boar ecology and biosecurity. FAO Animal Production and Health ManualNo. 22. Rome: FAO, OIE and EC; 2019. 96 p. DOI: 10.4060/CA5987EN.
13. Mushagalusa C. A., Penrith M. L., Etter E. M. C. Spatiotemporal analysis of African swine fever outbreaks on South African smallholder farms, 1993–2018. J. S. Afr. Vet. Assoc. 2022; 93 (2): 82–88. DOI: 10.36303/JSAVA.161.
14. Mogano K., Suzuki T., Mohale D., Phahladira B., Ngoepe E., Kamata Y., et al. Spatio-temporal epidemiology of animal and human rabies in northern South Africa between 1998 and 2017. PLoS Negl. Trop. Dis. 2022; 16 (7):e0010464. DOI: 10.1371/journal.pntd.0010464.
15. Lu X., Ward M. P. Spatiotemporal analysis of reported classicalswine fever outbreaks in China (2005–2018) and the influence of weather. Transbound. Emerg. Dis. 2022; 69 (5):e3183–e3195. DOI: 10.1111/tbed.14452.
16. GonzálezGordonL., PorphyreT., MuhanguziD., MuwongeA., BodenL., Bronsvoort B. M. C. A scoping review of foot-and-mouth disease risk, based on spatial and spatio-temporal analysis of outbreaks in endemic settings. Transbound. Emerg. Dis. 2022; 69 (6): 3198–3215. DOI: 10.1111/tbed.14769.
17. Gayawan E., Lima E. E. C. A spatio-temporal analysis of cause-specific mortality in São Paulo State, Brazil. Cien. Saude Colet. 2022; 27 (1): 287–298. DOI: 10.1590/1413-81232022271.32472020.
18. Wang Z., Dong W., Yang K. Spatiotemporal analysis and risk assessment model research of diabetes among people over 45 years old in China. Int. J. Environ. Res. Public Health. 2022; 19 (16):9861. DOI: 10.3390/ ijerph19169861.
19. KulldorffM. Aspatialscanstatistic. CommunicationsinStatistics –Theory and Methods.1997; 26 (6): 1481–1496. DOI: 10.1080/03610929708831995.
20. Kulldorff M., Heffernan R., Hartman J., Assunção R., Mostashari F. A space-time permutation scan statistic for disease outbreak detection. PLoS Med. 2005; 2 (3):e59. DOI: 10.1371/journal.pmed.0020059.
21. Kulldorff M. Prospective time periodic geographical disease surveillance using a scan statistic. J. R. Stat. Soc. Ser. A. 2001; 164 (1): 61–72. DOI: 10.1111/1467-985X.00186.
22. Nobre F. F., Stroup D. F. A monitoring system to detect changes in public health surveillance data. Int. J. Epidemiol. 1994; 23 (2): 408–418. DOI: 10.1093/ije/23.2.408.
23. SaTScanTM. Software for the spatial and space-time scan statistics. Режим доступа: https://www.satscan.org.
24. EFSA, Boklund A., Cay B., Depner K., Földi Z., Guberti V., et al. Epidemiological analyses of African swine fever in the European Union (November 2017 untilNovember 2018). EFSA J. 2018; 16 (11):е05494. DOI: 10.2903/j. efsa.2018.5494.
25. Lange M., Guberti V., Thulke H.-H. Understanding ASF spread and emergency control concepts in wild boar populations using individualbased modelling and spatio-temporal surveillance data. EFSA supp. publ. 2018; 15 (11):EN-1521. 46 р. DOI: 10.2903/sp.efsa.2018.EN-1521.
26. Lange M., Reichold A., Thulke H.-H. Modelling advanced knowledge of African swine fever, resulting surveillance patterns at the population level and impact on reliable exit strategy definition. EFSA supp. publ. 2021; 18 (3):EN-6429. 61 р. DOI: 10.2903/sp.efsa.2021.EN-6429.
27. Lim J.-S., Vergne T., Pak S.-I., Kim E. Modelling the spatial distribution of ASF-positive wild boar carcasses in South Korea using 2019–2020 nationalsurveillance data. Animals (Basel). 2021; 11 (5):1208. DOI: 10.3390/ ani11051208.
28. GervasiV., Marcon A., Bellini S., GubertiV. Evaluation ofthe efficiency of active and passive surveillance in the detection of African swine fever in wild boar. Vet. Sci. 2019; 7 (1):5. DOI: 10.3390/vetsci7010005.
29. Mazur-PanasiukN., ŻmudzkiJ., Woźniakowski G. African swine fever virus – persistence in different environmental conditions and the possibility of its indirect transmission. J. Vet. Res. 2019; 63 (3): 303–310. DOI: 10.2478/ jvetres-2019-0058.
30. Fischer M., Hühr J., Blome S., Conraths F. J., Probst C. Stability of African swine fever virus in carcasses of domestic pigs and wild boar ex perimentally infected with the ASFV “Estonia 2014” isolate. Viruses. 2020; 12 (10):1118. DOI: 10.3390/v12101118.
31. Kramer-Schadt S., Fernández N., Eisinger D., Grimm V., Thulke H.-H. Individual variations in infectiousness explain long-term disease persistence in wildlife populations. Oikos. 2009; 118 (2): 199–208. DOI: 10.1111/j.1600-0706.2008.16582.x.
32. O’Neil X., White A., Ruiz-Fons F., Gortázar C. Modelling the transmission and persistence of African swine fever in wild boar in contrasting European scenarios. Sci. Rep. 2020; 10 (1):5895. DOI: 10.1038/s41598-020- 62736-y.
33. EFSA, Nielsen S. S., Alvarez J., Bicout D. J., Calistri P., Depner K., et al. ASF exitstrategy: providing cumulative evidence of the absence of African swine fever virus circulation in wild boar populations using standard surveillance measures. EFSA J. 2021; 19 (3):е06419. DOI: 10.2903/j.efsa.2021.6419.
34. Podgórski T., Śmietanka K. Do wild boar movements drive the spread of African swine fever? Transbound. Emerg. Dis. 2018; 65 (6): 1588– 1596. DOI: 10.1111/tbed.12910.
35. Zani L., Masiulis M., Bušauskas P., Dietze K., Pridotkas G., Globig A., et al. African swine fever virussurvival in buried wild boar carcasses. Transbound. Emerg. Dis. 2020; 67 (5): 2086–2092. DOI: 10.1111/tbed.13554.
36. Gervasi V., Guberti V. African swine fever endemic persistence in wild boar populations: key mechanisms explored through modelling. Transbound. Emerg. Dis. 2021; 68 (5): 2812–2825. DOI: 10.1111/tbed.14194.
Рецензия
Для цитирования:
Захарова О.И., Блохин А.А., Бурова О.А., Яшин И.В., Коренной Ф.И. Пространственно-временной анализ распространения африканской чумы свиней в популяции диких кабанов на территории Российской Федерации в 2007–2022 гг. Ветеринария сегодня. 2023;12(1):57-65. https://doi.org/10.29326/2304-196X-2023-12-1-57-65
For citation:
Zakharova O.I., Blokhin A.A., Burova O.A., Yashin I.V., Korennoy F.I. Spatiotemporal analysis of African swine fever spread in wild boar population in Russian Federation, 2007–2022. Veterinary Science Today. 2023;12(1):57-65. https://doi.org/10.29326/2304-196X-2023-12-1-57-65
Просмотров:
984
Послать статью по эл. почте 