Генетический анализ нуклеотидных последовательностей гена нейраминидазы изолятов вируса высокопатогенного гриппа птиц A/H5N8, выделенных на территории Российской Федерации в 2020 году
П. Б. Акшалова,
Н. Г. Зиняков,
А. В. Андриясов,
П. Д. Жестков,
З. Б. Никонова,
С. Н. Колосов,
И. А. Чвала https://doi.org/10.29326/2304-196X-2021-10-4-301-307
Аннотация
Грипп птиц является особо опасной болезнью вирусной этиологии, наносящей огромный экономический ущерб птицеводству. В настоящее время в популяциях домашних и диких птиц в различных странах мира достаточно часто выявляют высоковирулентный вирус гриппа с нейраминидазой подтипа N8. В статье представлены данные по изучению полных нуклеотидных последовательностей гена нейраминидазы изолятов вируса высокопатогенного гриппа птиц, выделенных во второй половине 2020 г. из патологического материала, поступившего из четырех регионов Российской Федерации. В результате проведенных исследований определен подтип выделенного вируса – N8. Согласно данным филогенетического анализа, изоляты вируса N8 относятся к группе 8С.4. При проведении филогенетического анализа по нейраминидазе также учитывали данные классификации по гемагглютинину, согласно которой изоляты вируса Н5N8 относятся к широко распространенной кладе 2.3.4.4. Вирусы данной клады впервые зарегистрированы в 2010 г. в Китае и продолжают циркулировать до настоящего времени. Также в работе приведены данные сравнительного анализа нуклеотидных последовательностей исследуемых изолятов и изолятов из международных баз данных GenBank и GISAID, выделенных в других странах в период с 2007 по 2020 г. В ходе про- ведения анализа аминокислотной последовательности исследуемых изолятов в позициях, которые влияют на резистентность к ингибиторам нейрамини- даз, замен не обнаружено. Полные нуклеотидные последовательности гена нейраминидазы вируса гриппа птиц подтипа N8 изолятов A/domestic goose/ Omsk/1521-1/2020, A/duck/Chelyabinsk/1207-1/2020, A/duck/Saratov/1578-2/2020, A/goose/Tatarstan/1730-2/2020 опубликованы в международных базах GenBank и GISAID. На основании анализа нуклеотидных последовательностей изученных изолятов показана постепенная эволюция вируса подтипа N8.
Ключевые слова
При поддержке: Работа выполнена за счет средств ФГБУ «ВНИИЗЖ» в рамках тематики научно-исследовательских работ «Ветеринарное благополучие»
Об авторах
П. Б. Акшалова
ТОО «Казахский научно-исследовательский ветеринарный институт»
Казахстан
Казахстан
Акшалова Перизат Батырханкызы, кандидат ветеринарных наук, научный сотрудник отдела эпизоотологического мониторинга и оценки рисков вирусных болезней животных
г. Алматы
Н. Г. Зиняков
ФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных»
Россия
Россия
Зиняков Николай Геннадьевич, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник референтной лаборатории вирусных болезней птиц
г. Владимир
А. В. Андриясов
ФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных»
Россия
Россия
Андриясов Артем Валерьевич, кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник референтной лаборатории вирусных болезней птиц
г. Владимир
П. Д. Жестков
ФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных»
Россия
Россия
Жестков Павел Дмитриевич, аспирант, ведущий технолог референтной лаборатории вирусных болезней птиц
г. Владимир
З. Б. Никонова
ФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных»
Россия
Россия
Никонова Зоя Борисовна, кандидат биологических наук, научный сотрудник референтной лаборатории вирусных болезней птиц
г. Владимир
С. Н. Колосов
ФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных»
Россия
Россия
Колосов Сергей Николаевич, кандидат биологических наук, сотрудник референтной лаборатории вирусных болезней птиц
г. Владимир
И. А. Чвала
ФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных»
Россия
Россия
Чвала Илья Александрович, кандидат ветеринарных наук, заместитель директора по НИР
г. Владимир
Список литературы
1. Swayne D. E., Pantin-Jackwood M. Pathobiology of avian influenza virus infections in birds and mammals. In: Avian Influenza. Ed. by D. E. Swayne. Ames: Blackwell; 2008; 87–122.
2. Мельнов С. Б., Лебедь Т. Л., Кипень В. Н. Основы молекулярногенетического анализа. В кн.: Современные проблемы биохимии. Методы исследований. Е. В. Барковский и др.; под ред. проф. А. А. Чиркина. Минск: Вышэйшая школа; 2013; 404–438.
3. Murphy T. M. The control and epidemiology of an influenza A outbreak in Ireland. In: Acute Virus Infections of Poultry. Current Topics in Veterinary Medicine and Animal Science. Eds. J. B. McFerran, M. S. McNulty. Dordrecht: Springer; 1986; 37: 23–28. DOI: 10.1007/978-94-009-4287-5_2.
4. El-Shesheny R., Barman S., Feeroz M., Hasan M., Jones-Engel L., Franks J., et al. Genesis of influenza A (H5N8) viruses. Emerg. Infect. Dis. 2017; 23 (8): 1368–1371. DOI: 10.3201/eid2308.170143.
5. Марченко В. Ю., Суслопаров И. М., Колосова Н. П., Гончарова Н. И., Шиповалов А. В., Дурыманов А. Г. и др. Выделение высокопатогенного вируса гриппа А субтипа H5N8 на территории республики Саха (Якутия). Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2015; (28): 38–43. Режим доступа: https://infectpataog.elpub.ru/jour/article/view/127/128.
6. Lee D. H., Torchetti M. K., Winker K., Ip H. S., Song C. S., Swayne D. E. Intercontinental spread of Asian-origin H5N8 to North America through Beringia by migratory birds. J. Virol. 2015; 89 (12): 6521–6524. DOI: 10.1128/ JVI.00728-15.
7. Pohlmann A., Starick E., Harder T., Grund C., Höper D., Globig A., et al. Outbreaks among wild birds and domestic poultry caused by reassorted influenza A(H5N8) clade 2.3.4.4 viruses, Germany, 2016. Emerg. Infect. Dis. 2017; 23 (4): 633–636. DOI: 10.3201/eid2304.161949.
8. Dalby A. R., Iqbal M. The European and Japanese outbreaks of H5N8 derive from a single source population providing evidence for the dispersal along the long distance bird migratory flyways. Peer J. 2015; 3:e934. DOI: 10.7717/peerj.934.
9. Lee Y. J., Kang H. M., Lee E. K., Song B. M., Jeong J., Kwon Y. K., et al. Novel reassortant influenza A(H5N8) viruses, South Korea, 2014. Emerg. Infect. Dis. 2014; 20 (6): 1087–1089. DOI: 10.3201/eid2006.140233.
10. Zhao K., Gu M., Zhong L., Duan Z., Zhang Y., Zhu Y., et al. Characterization of three H5N5 and one H5N8 highly pathogenic avian influenza viruses in China. Vet. Microbiol. 2013; 163 (3–4): 351–357. DOI: 10.1016/j. vetmic.2012.12.025.
11. Волков М. С., Ирза В. Н., Варкентин А. В. Опыт ликвидации высокопатогенного гриппа птиц на территории Российской Федерации в 2016–2017 гг. Ветеринария сегодня. 2018; (1): 3–10. DOI: 10.29326/2304196X-2018-1-24-3-7.
12. Волкова М. А., Чвала Ир. А., Ярославцева П. С., Сосипаторова В. Ю., Осипова О. С., Чвала И. А. Серологический мониторинг гриппа птиц в Российской Федерации в 2017–2018 годах. Ветеринария сегодня. 2019; (2): 3–11. DOI: 10.29326/2304-196X-2019-2-29-3-7.
13. World Animal Health Information and Analysis Department. Highly Pathogenic Avian Influenza (HPAI). Report No. 17: October 23 to November 12, 2020. Available at: https://www.oie.int/app/uploads/2021/03/hpaiasof12112020.pdf.
14. Xu J., Davis C. T., Christman M. C., Rivailler P., Zhong H., Donis R. O., Lu G. Evolutionary history and phylodynamics of influenza A and B neuraminidase (NA) genes inferred from large-scale sequence analyses. PLoS One. 2012; 7 (7):e38665. DOI: 10.1371/journal.pone.0038665.
15. Kim Y. I., Pascua P. Q., Kwon H. I., Lim G. J., Kim E. H., Yoon S. W., et al. Pathobiological features of a novel, highly pathogenic avian influenza A(H5N8) virus. Emerg. Microbes Infect. 2014; 3 (10):e75. DOI: 10.1038/ emi.2014.75.
16. Lee D. H., Sharshov K., Swayne D. E., Kurskaya O., Sobolev I., Kabilov M., et al. Novel reassortant clade 2.3.4.4 avian influenza A(H5N8) virus in wild aquatic birds, Russia, 2016. Emerg. Infect. Dis. 2017; 23 (2): 359–360. DOI: 10.3201/eid2302.161252.
17. Liu M., Li X., Yuan H., Zhou J., Wu J., Bo H., et al. Genetic diversity of avian influenza A (H10N8) virus in live poultry markets and its association with human infections in China. Sci. Rep. 2015; 5:7632. DOI: 10.1038/ srep07632.
18. Bialy D., Shelton H. Functional neuraminidase inhibitor resistance motifs in avian influenza A(H5Nx) viruses. Antiviral Res. 2020; 182:104886. DOI: 10.1016/j.antiviral.2020.104886.
19. Oladejo B. O., Bi Y., Vavricka C. J., Li C., Chai Y., Xu K., et al. Structural insight into the mechanism of neuraminidase inhibitor-resistant mutations in human-infecting H10N8 influenza A virus. bioRxiv. 2018; 378075. DOI: 10.1101/378075.
20. Choi W. S., Jeong J. H., Kwon J. J., Ahn S. J., Lloren K. K. S., Kwon H. I., et al. Screening for neuraminidase inhibitor resistance markers among avian influenza viruses of the N4, N5, N6, and N8 neuraminidase subtypes. J. Virol. 2017; 92 (1):е01580-17. DOI: 10.1128/JVI.01580-17.
Рецензия
Для цитирования:
Акшалова П.Б., Зиняков Н.Г., Андриясов А.В., Жестков П.Д., Никонова З.Б., Колосов С.Н., Чвала И.А. Генетический анализ нуклеотидных последовательностей гена нейраминидазы изолятов вируса высокопатогенного гриппа птиц A/H5N8, выделенных на территории Российской Федерации в 2020 году. Ветеринария сегодня. 2021;10(4):301-307. https://doi.org/10.29326/2304-196X-2021-10-4-301-307
For citation:
Akshalova P.B., Zinyakov N.G., Andriyasov A.V., Zhestkov P.D., Nikonova Z.B., Kolosov S.N., Chvala I.A. Genetic analysis of nucleotide sequences of neuraminidase gene of highly pathogenic avian influenza A/H5N8 virus isolates recovered in the Russian Federation in 2020. Veterinary Science Today. 2021;10(4):301-307. https://doi.org/10.29326/2304-196X-2021-10-4-301-307
Просмотров:
470
Послать статью по эл. почте 