Сравнительное исследование ПЦР-наборов для выявления ДНК вируса АЧС
https://doi.org/10.29326/2304-196X-2021-3-38-209-215
Аннотация
В работе представлены результаты сравнения 12 отечественных диагностических наборов/ПЦР-тест-систем для выявления ДНК вируса африканской чумы свиней по таким показателям, как полнота и грамотность инструкций по применению; маркировка и комплектация; удобство использования наборов; стабильность работы реагентов в течение срока хранения; стабильность реагентов после транспортировки и многократного замораживания – оттаивания; межсерийная сходимость; чувствительность при тестировании различного материала и специфичность наборов. Изучение инструкций по применению и комплектации наборов выявило неполноту некоторых инструкций. Отмечено, что отдельные производители допускают в инструкциях серьезные ошибки, которые могут существенно повлиять на интерпретацию результатов исследования. Также отмечена недостаточность контроля производственного процесса, результатом которой является выпуск неработоспособных наборов, а также наборов с низким качеством компонентов и ошибками в их маркировке. Так, при проведении исследования один набор показал свою неработоспособность, демонстрируя отсутствие кривых накопления флуоресцентного сигнала как при амплификации положительных контролей, так и ДНК изолятов вируса АЧС. При оценке специфичности все наборы показали отсутствие неспецифических реакций и приемлемую чувствительность при тестировании различных типов материала (крови, суспензий свиной селезенки и черевы свиной, используемой при производстве колбасных изделий), содержащих вирус АЧС. Проверка стабильности показала резкое ухудшение качества работы одного набора в пределах срока годности, для другого набора выявлено существенное снижение уровня флуоресцентного сигнала при многократном замораживании – оттаивании. Сравнение сходимости результатов работы разных серий наборов одного производителя показало существенные расхождения для 41,5% наборов. Установлено, что лишь у 33% рассмотренных наборов для выявления ДНК вируса АЧС отсутствуют какие-либо недостатки. Результаты проведенной работы демонстрируют необходимость контроля выпускаемых диагностических наборов, используемых в государственных программах мониторинга заболеваний животных.
Ключевые слова
Об авторах
М. С. КрасниковаРоссия
Красникова Мария Сергеевна, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник отдела генодиагностики инфекционных болезней животных отделения биотехнологии
Москва
С. П. Яцентюк
Россия
Яцентюк Светлана Петровна, кандидат биологических наук, заведующий отделом генодиагностики инфекционных болезней животных отделения биотехнологии
123022, Москва, Звенигородское шоссе, 5
М. Б. Брюсова
Россия
Брюсова Мария Борисовна, кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник, заведующий отделом исследований биологических объектов
Москва
А. Д. Козлова
Россия
Козлова Александра Дмитриевна, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник отдела генодиагностики инфекционных болезней животных отделения биотехнологии
Москва
М. А. Гергель
Россия
Гергель Мария Александровна, заместитель директора, руководитель испытательного центра
Москва
Список литературы
1. Эпизоотическая ситуация по АЧС в Российской Федера- ции в 2020 г. Режим доступа: https://fsvps.gov.ru/fsvps-docs/ru/iac/asf/2020/12-31/01.pdf (дата обращения: 02.01.2021).
2. Поляков И. В., Соколова Н. С. Практическое пособие по медицинской статистике. Л.: Медицина; 1975; 26–30.
3. Полякова В. В., Шаброва Н. В. Основы теории статистики: учебное пособие. 2-е изд., испр. и доп. Екатеринбург: Издательство Уральского университета; 2015. 145 с.
4. Sundar Rao P. S. S., Richard J. Introduction to biostatistics and research methods. 5th ed. New Delhi: PHI Learning Private Limited; 2012. 280 p.
5. МУ 1.3-2569-09 Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I–IV групп патогенности: методические указания. М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора; 2010. 51 с. Режим доступа: https://www.rospotrebnadzor.ru/documents/details.php?ELEMENT_ID=4801.
Рецензия
Для цитирования:
Красникова М.С., Яцентюк С.П., Брюсова М.Б., Козлова А.Д., Гергель М.А. Сравнительное исследование ПЦР-наборов для выявления ДНК вируса АЧС. Ветеринария сегодня. 2021;10(3):209-215. https://doi.org/10.29326/2304-196X-2021-3-38-209-215
For citation:
Krasnikova M.S., Yatsentyuk S.P., Bryusova M.B., Kozlova A.D., Gergel М.А. Comparative study of PCR test kits for ASFV DNA detection. Veterinary Science Today. 2021;10(3):209-215. https://doi.org/10.29326/2304-196X-2021-3-38-209-215