Preview

Ветеринария сегодня

Расширенный поиск

АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКИХ СВОЙСТВ ИЗОЛЯТА ВИРУСА ГРИППА A/CHICKEN/CHELYABINSK/30/2019 H9N2, ВЫДЕЛЕННОГО НА ТЕРРИТОРИИ ЧЕЛЯБИНСКОЙ ОБЛАСТИ

https://doi.org/10.29326/2304-196X-2019-4-31-49-53

Полный текст:

Аннотация

В работе представлены данные по изучению генетических свойств изолята вируса гриппа А/chicken/Chelyabinsk/30/2019 H9N2, выделенного в феврале 2019 г. из патологического материала (внутренних органов кур), поступившего из птицехозяйства Челябинской области. В результате вирусологических исследований определили подтип выделенного вируса – Н9N2. При секвенировании участка гена гемагглютинина установлена аминокислотная последовательность сайта нарезания RSSR/GLF, характерная для низковирулентного вируса гриппа птиц. Филогенетический анализ полученных нуклеотидных последовательностей фрагмента гена гемагглютинина (1–1539 п. н. открытой рамки считывания) показал принадлежность изолята А/chicken/Chelyabinsk/30/2019 H9N2 к генетической группе G1 низковирулентного вируса гриппа А/Н9, представители которой широко распространены в странах Ближнего Востока и Средней Азии. Определена полная нуклеотидная последовательность генома исследуемого патогена. В результате сравнительного анализа всех геномных сегментов с использованием базы данных GenBank установлено высокое родство (более 99%) вируса А/chicken/Chelyabinsk/30/2019 H9N2 с изолятами вируса гриппа А/Н9, циркулировавшими на территории Израиля в 2006–2012 гг. Согласно анализу предсказанной аминокислотной последовательности изучаемого изолята выявлены позиции некоторых молекулярных маркеров, определяющие биологические свойства вируса. Большинство аминокислотных позиций гемагглютинина (по нумерации последовательности подтипа Н3) предполагают сродство к АСА2-3Gal-рецепторам эпителиальных клеток птиц. Выявлены аминокислотные замены на участке рецептор-связывающего домена в сравнении с изолятами вируса гриппа A/ H9N2, выделенными на территории России в 2018 г. Первичная структура генома изолята A/chicken/Chelyabinsk/30/2019 H9N2 имеет очень высокий уровень генетического сходства по всем генам с изолятом вируса гриппа A/chicken/Israel/215/2007 H9N2, использовавшимся в качестве вакцинного штамма.

Об авторах

Н. Г. Зиняков
ФГБУ «ВНИИЗЖ»
Россия

Старший научный сотрудник, кандидат биологических наук

Владимир 



О. С. Осипова
ФГБУ «ВНИИЗЖ»
Россия

Ветеринарный врач

Владимир 



П. Б. Акшалова
ФГБУ «ВНИИЗЖ»
Россия

Аспирант

Владимир 



В. Ю. Сосипаторова
ФГБУ «ВНИИЗЖ»
Россия

Младший научный сотрудник, кандидат биологических наук

Владимир 



А. В. Андриясов
ФГБУ «ВНИИЗЖ»
Россия

Ведущий научный сотрудник, кандидат биологических наук

Владимир



Д. Б. Андрейчук
ФГБУ «ВНИИЗЖ»
Россия

Заведующий лабораторией, кандидат биологических наук

Владимир 



И. А. Чвала
ФГБУ «ВНИИЗЖ»
Россия

Заместитель директора по НИР и мониторингу, кандидат ветеринарных наук

Владимир



Список литературы

1. A global perspective on H9N2 avian infl uenza virus / T. P. Peacock, J. James, J. E. Sealy, M. Iqbal // Viruses. – 2019. – Vol. 11 (7):e620; DOI: 10.3390/v11070620.

2. A novel genotype H9N2 infl uenza virus possessing human H5N1 internal genomes has been circulating in poultry in eastern China since 1998 / P. Zhang, Y. Tang, X. Liu [et al.] // J. Virol. – 2009. – Vol. 83 (17). – P. 8428–8438; DOI: 10.1128/JVI.00659-09.

3. Alexander D. J. Summary of avian infl uenza activity in Europe, Asia, Africa, and Australasia, 2002–2006 // Avian Dis. – 2007. – Vol. 51 (Suppl. 1). – P. 161–166; DOI: 10.1637/7602-041306R.1.

4. Avian infl uenza (infection with avian infl uenza viruses) // Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals / OIE. – 2018. – Chap. 3.3.4. – URL: https://www.oie.int/fileadmin/Home/eng/Health_standards/tahm/3.03.04_AI.pdf (дата обращения: 12.11.19).

5. Avian influenza A subtype H9N2 in poultry in Pakistan / K. Naeem, A. Ullah, R. J. Manvell, D. J. Alexander // Vet. Rec. – 1999. – Vol. 145 (19). – P. 560; DOI: 10.1136/vr.145.19.560.

6. Characterization of the pathogenicity of members of the newly established H9N2 infl uenza virus lineages in Asia / Y. J. Guo, S. Krauss, D. A. Senne [et al.] // Virology. – 2000. – Vol. 267 (2). – P. 279–288; DOI: 10.1006/viro.1999.0115.

7. Genesis of avian infl uenza H9N2 in Bangladesh / K. Shanmuganatham, M. M. Feeroz, L. Jones-Engel [et al.] // Emerg. Microbes Infect. – 2014. – Vol. 3 (12):e88; DOI: 10.1038/emi.2014.84.

8. Genetic characterization of HA gene of low pathogenic H9N2 infl uenza viruses isolated in Israel during 2006–2012 periods / I. Davidson, I. Shkoda, N. Golender [et al.] // Virus Genes. – 2013. – Vol. 46 (2). – P. 255– 263; DOI: 10.1007/s11262-012-0852-4.

9. Genetic conservation of hemagglutinin gene of H9 influenza virus in chicken population in Mainland China / J.-H. Liu, K. Okazaki, A. Mweene [et al.] // Virus Genes. – 2004. – Vol. 29 (3). – P. 329–334; DOI: 10.1007/s11262-004-7436-x.

10. Genome sequencing and phylogenetic analysis of three avian infl uenza H9N2 subtypes in Guangxi / Z. Xie, J. Dong, X. Tang [et al.] // Virol. Sin. – 2009. – Vol. 24 (1). – P. 37–44; DOI: 10.1007/s12250-009-2985-8.

11. Infection with avian infl uenza viruses // Terrestrial Animal Health Code / OIE. – 2019. – Vol. 2, Chap. 10.4. – URL: https://www.oie.int/standardsetting/terrestrial-code/access-online (дата обращения: 12.11.19).

12. Molecular evolution of H9N2 avian infl uenza viruses in Israel / I. Davidson, A. Fusaro, A. Heidari [et al.] // Virus Genes. – 2014. – Vol. 48 (3). – P. 457–463; DOI: 10.1007/s11262-014-1037-0.

13. Phylogenetic analysis of influenza A viruses of H9 haemagglutinin subtype / J. Banks, E. C. Speidel, P. A. Harris, D. J. Alexander // Avian Pathol. – 2000. – Vol. 29 (4). – P. 353–359; DOI: 10.1080/03079450050118485.

14. Senne D. A. Avian influenza in the Western Hemisphere including the Pacific Islands and Australia // Avian Dis. – 2003. – Vol. 47 (Suppl. 3). – P. 798–805; DOI: 10.1637/0005-2086-47.s3.798.

15. Spackman E. Influenza subtype identification with molecular methods // Methods Mol. Biol. – 2014. – Vol. 1161. – P. 119–123; DOI: 10.1007/978-1-4939-0758-8_11.

16. Spackman E., Killian M. L. Avian influenza virus isolation, propagation, and titration in embryonated chicken eggs // Methods Mol. Biol. – 2014. – Vol. 1161. – P. 125–140; DOI: 10.1007/978-1-4939-0758-8_12.

17. Structure and receptor specifi city of the hemagglutinin from an H5N1 infl uenza virus / J. Stevens, O. Blixt, T. M. Tumpey [et al.] // Science. – 2006. – Vol. 312 (5772). – P. 404–410; DOI: 10.1126/science.1124513.

18. Wan H., Perez D. R. Amino acid 226 in the hemagglutinin of H9N2 infl uenza viruses determines cell tropism and replication in human airway epithelial cells // J. Virol. – 2007. – Vol. 81 (10). – P. 5181–5191; DOI: 10.1128/JVI.02827-06.


Для цитирования:


Зиняков Н.Г., Осипова О.С., Акшалова П.Б., Сосипаторова В.Ю., Андриясов А.В., Андрейчук Д.Б., Чвала И.А. АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКИХ СВОЙСТВ ИЗОЛЯТА ВИРУСА ГРИППА A/CHICKEN/CHELYABINSK/30/2019 H9N2, ВЫДЕЛЕННОГО НА ТЕРРИТОРИИ ЧЕЛЯБИНСКОЙ ОБЛАСТИ. Ветеринария сегодня. 2019;(4):49-53. https://doi.org/10.29326/2304-196X-2019-4-31-49-53

For citation:


Zinyakov N.G., Osipova Щ.S., Akshalova P.B., Sosipatorova V.Y., Andriyasov A.V., Andreychuk D.B., Chvala I.A. ANALYSIS OF GENETIC CHARACTERISTICS OF INFLUENZA VIRUS A/CHICKEN/CHELYABINSK/30/2019 H9N2 ISOLATED IN CHELYABINSK OBLAST. Veterinary Science Today. 2019;(4):49-53. (In Russ.) https://doi.org/10.29326/2304-196X-2019-4-31-49-53

Просмотров: 58


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2304-196X (Print)
ISSN 2658-6959 (Online)