АНАЛИЗ ГЕНЕТИЧЕСКИХ СВОЙСТВ ИЗОЛЯТА ВИРУСА ГРИППА A/CHICKEN/CHELYABINSK/30/2019 H9N2, ВЫДЕЛЕННОГО НА ТЕРРИТОРИИ ЧЕЛЯБИНСКОЙ ОБЛАСТИ

В работе представлены данные по изучению генетических свойств изолята вируса гриппа А/chicken/Chelyabinsk/30/2019 H9N2, выделенного в феврале 2019 г. из патологического материала (внутренних органов кур), поступившего из птицехозяйства Челябинской области. В результате вирусологических исследований определили подтип выделенного вируса – Н9N2. При секвенировании участка гена гемагглютинина установлена аминокислотная последовательность сайта нарезания RSSR/GLF, характерная для низковирулентного вируса гриппа птиц. Филогенетический анализ полученных нуклеотидных последовательностей фрагмента гена гемагглютинина (1–1539 п. н. открытой рамки считывания) показал принадлежность изолята А/chicken/Chelyabinsk/30/2019 H9N2 к генетической группе G1 низковирулентного вируса гриппа А/Н9, представители которой широко распространены в странах Ближнего Востока и Средней Азии. Определена полная нуклеотидная последовательность генома исследуемого патогена. В результате сравнительного анализа всех геномных сегментов с использованием базы данных GenBank установлено высокое родство (более 99%) вируса А/chicken/Chelyabinsk/30/2019 H9N2 с изолятами вируса гриппа А/Н9, циркулировавшими на территории Израиля в 2006–2012 гг. Согласно анализу предсказанной аминокислотной последовательности изучаемого изолята выявлены позиции некоторых молекулярных маркеров, определяющие биологические свойства вируса. Большинство аминокислотных позиций гемагглютинина (по нумерации последовательности подтипа Н3) предполагают сродство к АСА2-3Gal-рецепторам эпителиальных клеток птиц. Выявлены аминокислотные замены на участке рецептор-связывающего домена в сравнении с изолятами вируса гриппа A/ H9N2, выделенными на территории России в 2018 г. Первичная структура генома изолята A/chicken/Chelyabinsk/30/2019 H9N2 имеет очень высокий уровень генетического сходства по всем генам с изолятом вируса гриппа A/chicken/Israel/215/2007 H9N2, использовавшимся в качестве вакцинного штамма.

1. A global perspective on H9N2 avian infl uenza virus / T. P. Peacock, J. James, J. E. Sealy, M. Iqbal // Viruses. – 2019. – Vol. 11 (7):e620; DOI: 10.3390/v11070620.

2. A novel genotype H9N2 infl uenza virus possessing human H5N1 internal genomes has been circulating in poultry in eastern China since 1998 / P. Zhang, Y. Tang, X. Liu [et al.] // J. Virol. – 2009. – Vol. 83 (17). – P. 8428–8438; DOI: 10.1128/JVI.00659-09.

3. Alexander D. J. Summary of avian infl uenza activity in Europe, Asia, Africa, and Australasia, 2002–2006 // Avian Dis. – 2007. – Vol. 51 (Suppl. 1). – P. 161–166; DOI: 10.1637/7602-041306R.1.

4. Avian infl uenza (infection with avian infl uenza viruses) // Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals / OIE. – 2018. – Chap. 3.3.4. – URL: https://www.oie.int/fileadmin/Home/eng/Health_standards/tahm/3.03.04_AI.pdf (дата обращения: 12.11.19).

5. Avian influenza A subtype H9N2 in poultry in Pakistan / K. Naeem, A. Ullah, R. J. Manvell, D. J. Alexander // Vet. Rec. – 1999. – Vol. 145 (19). – P. 560; DOI: 10.1136/vr.145.19.560.

6. Characterization of the pathogenicity of members of the newly established H9N2 infl uenza virus lineages in Asia / Y. J. Guo, S. Krauss, D. A. Senne [et al.] // Virology. – 2000. – Vol. 267 (2). – P. 279–288; DOI: 10.1006/viro.1999.0115.

7. Genesis of avian infl uenza H9N2 in Bangladesh / K. Shanmuganatham, M. M. Feeroz, L. Jones-Engel [et al.] // Emerg. Microbes Infect. – 2014. – Vol. 3 (12):e88; DOI: 10.1038/emi.2014.84.

8. Genetic characterization of HA gene of low pathogenic H9N2 infl uenza viruses isolated in Israel during 2006–2012 periods / I. Davidson, I. Shkoda, N. Golender [et al.] // Virus Genes. – 2013. – Vol. 46 (2). – P. 255– 263; DOI: 10.1007/s11262-012-0852-4.

9. Genetic conservation of hemagglutinin gene of H9 influenza virus in chicken population in Mainland China / J.-H. Liu, K. Okazaki, A. Mweene [et al.] // Virus Genes. – 2004. – Vol. 29 (3). – P. 329–334; DOI: 10.1007/s11262-004-7436-x.

10. Genome sequencing and phylogenetic analysis of three avian infl uenza H9N2 subtypes in Guangxi / Z. Xie, J. Dong, X. Tang [et al.] // Virol. Sin. – 2009. – Vol. 24 (1). – P. 37–44; DOI: 10.1007/s12250-009-2985-8.

11. Infection with avian infl uenza viruses // Terrestrial Animal Health Code / OIE. – 2019. – Vol. 2, Chap. 10.4. – URL: https://www.oie.int/standardsetting/terrestrial-code/access-online (дата обращения: 12.11.19).

12. Molecular evolution of H9N2 avian infl uenza viruses in Israel / I. Davidson, A. Fusaro, A. Heidari [et al.] // Virus Genes. – 2014. – Vol. 48 (3). – P. 457–463; DOI: 10.1007/s11262-014-1037-0.

13. Phylogenetic analysis of influenza A viruses of H9 haemagglutinin subtype / J. Banks, E. C. Speidel, P. A. Harris, D. J. Alexander // Avian Pathol. – 2000. – Vol. 29 (4). – P. 353–359; DOI: 10.1080/03079450050118485.

14. Senne D. A. Avian influenza in the Western Hemisphere including the Pacific Islands and Australia // Avian Dis. – 2003. – Vol. 47 (Suppl. 3). – P. 798–805; DOI: 10.1637/0005-2086-47.s3.798.

15. Spackman E. Influenza subtype identification with molecular methods // Methods Mol. Biol. – 2014. – Vol. 1161. – P. 119–123; DOI: 10.1007/978-1-4939-0758-8_11.

16. Spackman E., Killian M. L. Avian influenza virus isolation, propagation, and titration in embryonated chicken eggs // Methods Mol. Biol. – 2014. – Vol. 1161. – P. 125–140; DOI: 10.1007/978-1-4939-0758-8_12.

17. Structure and receptor specifi city of the hemagglutinin from an H5N1 infl uenza virus / J. Stevens, O. Blixt, T. M. Tumpey [et al.] // Science. – 2006. – Vol. 312 (5772). – P. 404–410; DOI: 10.1126/science.1124513.

18. Wan H., Perez D. R. Amino acid 226 in the hemagglutinin of H9N2 infl uenza viruses determines cell tropism and replication in human airway epithelial cells // J. Virol. – 2007. – Vol. 81 (10). – P. 5181–5191; DOI: 10.1128/JVI.02827-06.