ВИРУС АФРИКАНСКОЙ ЧУМЫ СВИНЕЙ: ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ ПРИ АНАЛИЗЕ ПУТЕЙ ЕГО РАСПРОСТРАНЕНИЯ


https://doi.org/10.29326/2304-196X-2019-3-30-3-8

Полный текст:


Аннотация

На сегодняшний день эффективных мер специфической профилактики и лечения африканской чумы свиней не разработано. Стратегия борьбы с болезнью направлена на быструю диагностику инфицированных животных с последующим убоем и деконтаминационными мероприятиями (стемпинг аут). В настоящем обзоре представлена современная эпизоотическая ситуация по африканской чуме свиней, рассмотрены особенности генетической организации вируса и принципы генетической дифференциации изолятов. Российская Федерация неблагополучна по африканской чуме свиней с 2007 года. С этого времени заболевание является одной из ключевых проблем свиноводческой отрасли нашей страны, нанося огромный прямой и косвенный экономический ущерб. Болезнь продолжает неумолимо распространяться. Так, в январе 2014 года африканская чума свиней была занесена на территорию Литвы, позднее охватила Польшу, Латвию, Эстонию, Румынию, Венгрию, Бельгию, Молдову, а с 2018 года вспышки болезни регистрировали уже и в Азии (Китай, Вьетнам, Монголия). Особая структура вируса, длинный нерасшифрованный геном, включая гены с неизвестной функцией, а также циркуляция 24 генотипов и 9 серотипов вируса являются причиной отсутствия эффективной вакцины против африканской чумы свиней. Показано, что использование большого количества специфических генетических маркеров при определении родства и изучении путей распространения вируса африканской чумы свиней в мире является наиболее точным методом.


Об авторах

А. Мазлум
ФГБУ «ВНИИЗЖ»
Россия

Али Мазлум

Биолог, кандидат биологических наук



А. С. Иголкин
ФГБУ «ВНИИЗЖ»
Россия
Заведующий лабораторией, кандидат ветеринарных наук


Н. Н. Власова
ФГБУ «ВНИИЗЖ»
Россия
Главный научный сотрудник, доктор биологических наук


Д. В. Роменская
ФГБУ «ВНИИЗЖ»
Россия
Заведующий сектором, кандидат ветеринарных наук


Список литературы

1. Анализ изменений генетической структуры и биологических свойств вируса африканской чумы свиней при адаптации к перевиваемой культуре клеток / А. Мазлум, Н. Г. Зиняков, А. С. Першин [и др.] // Ветеринария сегодня. – 2018. – № 4. – Р. 21–25; DOI: 10.29326/2304-196X2018-4-27-21-25.

2. Анализ результатов мониторинговых исследований по выявлению ДНК вируса африканской чумы свиней, проведенных в 2017 г. / Д. Н. Федосеева, Е. В. Аронова, А. А. Варенцова [и др.] // Ветеринария сегодня. – 2018. – № 3. – С. 21–25; DOI: 10.29326/2304-196X-2018-3-26-21-25.

3. Федеральная служба по ветеринарному и фитосанитарному надзору (Россельхознадзор). – 2019. – URL: https://www.fsvps.ru/fsvps-docs/ru/iac/asf/2019/08-12/03.pdf.

4. African swine fever virus controls the host transcription and cellular machinery of protein synthesis / E. G. Sanchez, A. Quintas, M. Nogal [et al.] // Virus Res. – 2013. – Vol. 173 (1). – P. 58–75; DOI: 10.1016/j.virusres.2012.10.025.

5. African swine fever virus eradication in Africa / M. L. Penrith, W. Vosloo, F. Jori, A. D. Bastos // Virus Res. – 2013. – Vol. 173 (1). – P. 228–246; DOI: 10.1016/j.virusres.2012.10.011.

6. African swine fever virus include multiple mechanisms for the manipulation of interferon responses / S. Correia, S. Ventura, S. Goodbourn, R. М. E. Parkhouse // Cytokine. – 2013. – Vol. 63 (3). – P. 256; DOI: 10.1016/j. cyto.2013.06.058.

7. African swine fever virus isolate, Georgia, 2007 / R. J. Rowlands, V. Michaud, L. Heath [et al.] // Emerg. Infect. Dis. – 2008. – Vol. 14 (12). – P. 1870–1874; DOI: 10.3201/eid1412.080591.

8. African swine fever virus replication and genomics / L. K. Dixon, D. A. Chapman, C. L. Netherton, C. Upton // Virus Res. – 2013. – Vol. 173 (1). – P. 3–14; DOI: 10.1016/j.virusres.2012.10.020.

9. African swine fever virus. EFSA Panel on Animal Health and Welfare (AHAW) // EFSA J. – 2015. – Vol. 13 (7):4163; DOI: 10.2903/j.efsa.2015.4163.

10. An update on the epidemiology and pathology of African swine fever / J. M. Sánchez-Vizcaíno, L. Mur, J. C. Gomez-Villamandos, L. Carrasco // J. Comp. Pathol. – 2015. – Vol. 152 (1). – P. 9–21; DOI: 10.1016/j.jcpa.2014.09.003.

11. Assessment of African swine fever diagnostic techniques as a response to the epidemic outbreaks in Eastern European Union Countries: How to improve surveillance and control programs / C. Gallardo, R. Nieto, A. Soler [et al.] // J. Clin. Microbiol. – 2015. – Vol. 53 (8). – Р. 2555–2565; DOI: 10.1128/JCM.00857-15.

12. Attenuated and non-haemadsorbing (non-HAD) genotype II African swine fever virus (ASFV) isolated in Europe, Latvia 2017 / C. Gallardo, A. Soler, I. Rodze [et al.] // Transbound. Emerg. Dis. – 2019. – Vol. 66 (3). – P. 1399–1404; DOI: 10.1111/tbed.13132.

13. Blome S., Gabriel C., Beer M. Pathogenesis of African swine fever in domestic pigs and European wild boar // Virus Res. – 2013. – Vol. 173 (1). – P. 122–130; DOI: 10.1016/j.virusres.2012.10.026.

14. Breese, Jr. S. S., De Boer C. J. Electron microscope observation of African swine fever virus in tissue culture cells // Virology. – 1966. – Vol. 28 (3). – P. 420–428; DOI: 10.1016/0042-6822(66)90054-7.

15. Comparison of the genome sequences of non-pathogenic and pathogenic African swine fever virus isolates / D. A. Chapman, V. Tcherepanov, C. Upton, L. K. Dixon // J. Gen. Virol. – 2008. – Vol. 89 (Pt. 2). – Р. 397–408; DOI: 10.1099/vir.0.83343-0.

16. Course and transmission characteristics of oral low-dose infection of domestic pigs and European wild boar with a Caucasian African swine fever virus isolate / J. Pietschmann, C. Guinat, M. Beer [et al.] // Arch. Virol. – 2015. – Vol. 160 (7). – P. 1657–1667; DOI: 10.1007/s00705-015-2430-2.

17. Detection of African swine fever antibodies in experimental and field samples from the Russian Federation: implications for control / L. Mur, A. Igolkin, A. Varentsova [et al.] // Transbound. Emerg. Dis. – 2016. – Vol. 63 (5). – P. 436–440; DOI: 10.1111/tbed.12304.

18. Dixon L. K. Molecular cloning and restriction enzyme mapping of an African swine fever virus isolate from Malawi // J. Gen. Virol. – 1988. – Vol. 69 (Pt. 7). – Р. 1683–1694; DOI: 10.1099/0022-1317-69-7-1683.

19. Enhanced discrimination of African swine fever virus isolates through nucleotide sequencing of the p54, p72, and pB602L (CVR) genes / C. Gallardo, D. M. Mwaengo, J. M. Macharia [et al.] // Virus Genes. – 2009. – Vol. 38 (1). – P. 85–95; DOI: 10.1007/s11262-008-0293-2.

20. Genetic characterization of African swine fever virus isolates from soft ticks at the wildlife/domestic interface in Mozambique and identification of a novel genotype / C. J. Quembo, F. Jori, W. Vosloo, L. Heath // Transbound. Emerg. Dis. – 2018. – Vol. 65 (2). – P. 420–431; DOI: 10.1111/tbed.12700.

21. Genetic characterization of African swine fever viruses from a 2008 outbreak in Tanzania / G. Misinzo, J. Magambo, J. Masambu [et al.] // Transbound. Emerg. Dis. – 2011. – Vol. 58 (1). – P. 86–92; DOI: 10.1111/j.1865- 1682.2010.01177.x.

22. Genetic characterization of circulating African swine fever viruses in Nigeria (2007–2015) / P. D. Luka, J. E. Achenbach, F. N. Mwiine [et al.] // Transbound. Emerg. Dis. – 2017. – Vol. 64. – P. 1598–1609; DOI: 10.1111/tbed.12553.

23. Genetic variation among African swine fever genotype II viruses, eastern and central Europe / C. Gallardo, J. Fernández-Pinero, V. Pelayo [et al.] // Emerg. Infect. Dis. – 2014. – Vol. 20 (9). – P. 1544–1547; DOI: 10.3201/ eid2009.140554.

24. Genome sequences derived from pig and dried blood pig feed samples provide important insights into the transmission of African swine fever virus in China in 2018 / X. Wen, X. He, X. Zhang [et al.] // Emerg. Microbes Infect. – 2019. – Vol. 8 (1). – P. 303–306; DOI: 10.1080/22221751. 2019.1565915.

25. Genomic analysis of highly virulent Georgia 2007/1 isolate of African swine fever virus / D. A. Chapman, A. C. Darby, M. Da Silva [et al.] // Emerg. Infect. Dis. – 2011. – Vol. 17 (4). – P. 599–605; DOI: 10.3201/eid1704.101283.

26. Genotyping field strains of African swine fever virus by partial p72 gene characterization / A. D. Bastos, M. L. Penrith, C. Crucière [et al.] // Arch. Virol. – 2003. – Vol. 148 (4). – P. 693–706; DOI: 10.1007/s00705-002-0946-8.

27. In vivo experimental studies of genotype II African swine fever virus (ASFV) isolates currently circulating in two Estonian counties / C. Gallardo, A. Soler, V. Delicado [et al.] // Proc. 10th Annual Meeting EPIZONE, 27–29 September 2016. – Madrid, 2016. – P. 81.

28. Molecular characterization of African swine fever virus (ASFV) isolates circulating in the Eastern European Union countries 2014–2016 / R. Nieto, A. Soler, I. Nurmoja [et al.] // Proc. 10th Annual Meeting EPIZONE, 27–29 September 2016. – Madrid, 2016. – P. 164.

29. Molecular epidemiology of African swine fever in East Africa / B. A. Lubisi, A. D. Bastos, R. M. Dwarka, W. Vosloo // Arch. Virol. – 2005. – Vol. 150 (12). – Р. 2439–2452; DOI: 10.1007/s00705-005-0602-1.

30. Molecular epidemiology of African swine fever virus studied by analysis of four variable genome regions / R. J. Nix, C. Gallardo, G. Hutchings [et al.] // Arch. Virol. – 2006. – Vol. 151 (12). – Р. 2475–2494; DOI: 10.1007/ s00705-006-0794-z.

31. Phylodynamics and evolutionary epidemiology of African swine fever p72-CVR genes in Eurasia and Africa / M. A. Alkhamis, C. Gallardo, C. Jurado [et al.] // PLoS ONE. – 2018. – Vol. 13 (2):e0192565; DOI: 10.1371/ journal.pone.0192565.

32. Phylogenomic analysis of 11 complete African swine fever virus genome sequences / E. P. de Villiers, C. Gallardo, M. Arias [et al.] // Virology. – 2010. – Vol. 400 (1). – P. 128–136; DOI: 10.1016/j.virol.2010.01.019.

33. Tandem repeat sequence in the intergenic region MGF 505 9R/10R is a new marker of the genetic variability among ASF Genotype II viruses / A. Elsukova, I. Shevchenko, A. Varentsova [et al.] // Proc. 10th Annual Meeting EPIZONE, 27–29 September 2016. – Madrid, 2016. – P. 78.

34. Variable and constant regions in African swine fever virus DNA // R. Blasco, M. Agüero, J. M. Almendral, E. Viñuela // Virology. – 1989. – Vol. 168 (2). – P. 330–338; DOI: 10.1016/0042-6822(89)90273-0.

35. World Animal Health Information Database (WAHID Interface) / OIE. – 2018. – URL: https://www.oie.int/wahis_2/public/wahid.php/Diseaseinformation/WI.


Дополнительные файлы

Для цитирования: Мазлум А., Иголкин А.С., Власова Н.Н., Роменская Д.В. ВИРУС АФРИКАНСКОЙ ЧУМЫ СВИНЕЙ: ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ ПРИ АНАЛИЗЕ ПУТЕЙ ЕГО РАСПРОСТРАНЕНИЯ. Ветеринария сегодня. 2019;(3):3-14. https://doi.org/10.29326/2304-196X-2019-3-30-3-8

For citation: Mazloum A., Igolkin A.S., Vlasova N.N., Romenskaya D.V. AFRICAN SWINE FEVER VIRUS: USE OF GENETIC MARKERS IN ANALYSIS OF ITS ROUTES OF SPREAD. Veterinary Science Today. 2019;(3):3-14. (In Russ.) https://doi.org/10.29326/2304-196X-2019-3-30-3-8

Просмотров: 27

Обратные ссылки

  • Обратные ссылки не определены.


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2304-196X (Print)
ISSN 2658-6959 (Online)