<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">veterinary</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Ветеринария сегодня</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Veterinary Science Today</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2304-196X</issn><issn pub-type="epub">2658-6959</issn><publisher><publisher-name>"Veinard"</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.29326/2304-196X-2021-3-38-209-215</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">veterinary-573</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>БОЛЕЗНИ СВИНЕЙ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>PORCINE DISEASES</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Сравнительное исследование ПЦР-наборов  для выявления ДНК вируса АЧС</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Comparative study of PCR test kits for ASFV DNA detection</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-6248-419X</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Красникова</surname><given-names>М. С.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Krasnikova</surname><given-names>M. S.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Красникова Мария Сергеевна, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник отдела генодиагностики инфекционных болезней животных отделения биотехнологии</p><p>Москва</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Maria S. Krasnikova, Candidate of Science (Biology), Senior Researcher, Department for Genodiagnostics of Infectious Animal Diseases of VGNKI, Department of Biotechnology </p><p>Moscow</p></bio><email xlink:type="simple">m.krasnikova@vgnki.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4819-2131</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Яцентюк</surname><given-names>С. П.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Yatsentyuk</surname><given-names>S. P.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Яцентюк Светлана Петровна, кандидат биологических наук, заведующий отделом генодиагностики инфекционных болезней животных отделения биотехнологии</p><p>123022, Москва, Звенигородское шоссе, 5</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Svetlana P. Yatsentyuk, Candidate of Science (Biology), Head of the Department for Genodiagnostics of Infectious Animal Diseases of VGNKI, Department of Biotechnology </p><p>123022, Moscow, Zvenigorodskoye shosse, 5</p></bio><email xlink:type="simple">pcr-lab@vgnki.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Брюсова</surname><given-names>М. Б.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Bryusova</surname><given-names>M. B.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Брюсова Мария Борисовна, кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник, заведующий отделом исследований биологических объектов</p><p>Москва</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Maria B. Bryusova, Candidate of Science (Biology), Leading Researcher, Head of the Department for Biological Object Studies</p><p>Moscow</p></bio><email xlink:type="simple">m.bryusova@vgnki.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4793-2345</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Козлова</surname><given-names>А. Д.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kozlova</surname><given-names>A. D.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Козлова Александра Дмитриевна, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник отдела генодиагностики инфекционных болезней животных отделения биотехнологии</p><p>Москва</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Aleksandra D. Kozlova, Candidate of Science (Biology), Senior Researcher, Department for Genodiagnostics of Infectious Animal Diseases of VGNKI Department of Biotechnology </p><p>Moscow</p></bio><email xlink:type="simple">adkozlova@vgnki.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-8033-1154</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Гергель</surname><given-names>М. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Gergel</surname><given-names>М. А.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Гергель Мария Александровна, заместитель директора, руководитель испытательного центра</p><p>Москва</p></bio><bio xml:lang="en"><p>Mariya A. Gergel, Deputy Director and Head of Testing Center</p><p>Moscow</p></bio><email xlink:type="simple">m.gergel@vgnki.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБУ «Всероссийский государственный Центр качества и стандартизации лекарственных средств для животных и кормов» (ФГБУ «ВГНКИ»)</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>FSBI “The Russian State Centre for Quality and Standardization of Veterinary Drugs and Feed” (FSBI “VGNKI”)</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2021</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>16</day><month>08</month><year>2021</year></pub-date><volume>10</volume><issue>3</issue><fpage>209</fpage><lpage>215</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Красникова М.С., Яцентюк С.П., Брюсова М.Б., Козлова А.Д., Гергель М.А., 2021</copyright-statement><copyright-year>2021</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Красникова М.С., Яцентюк С.П., Брюсова М.Б., Козлова А.Д., Гергель М.А.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Krasnikova M.S., Yatsentyuk S.P., Bryusova M.B., Kozlova A.D., Gergel М.А.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://veterinary.arriah.ru/jour/article/view/573">https://veterinary.arriah.ru/jour/article/view/573</self-uri><abstract><p>В работе представлены результаты сравнения 12 отечественных диагностических наборов/ПЦР-тест-систем для выявления ДНК вируса африканской чумы свиней по таким показателям, как полнота и грамотность инструкций по применению; маркировка и комплектация; удобство использования наборов; стабильность работы реагентов в течение срока хранения; стабильность реагентов после транспортировки и многократного замораживания – оттаивания; межсерийная сходимость; чувствительность при тестировании различного материала и специфичность наборов. Изучение инструкций по применению и комплектации наборов выявило неполноту некоторых инструкций. Отмечено, что отдельные производители допускают в инструкциях серьезные ошибки, которые могут существенно повлиять на интерпретацию результатов исследования. Также отмечена недостаточность контроля производственного процесса, результатом которой является выпуск неработоспособных наборов, а также наборов с низким качеством компонентов и ошибками в их маркировке. Так, при проведении исследования один набор показал свою неработоспособность, демонстрируя отсутствие кривых накопления флуоресцентного сигнала как при амплификации положительных контролей, так и ДНК изолятов вируса АЧС. При оценке специфичности все наборы показали отсутствие неспецифических реакций и приемлемую чувствительность при тестировании различных типов материала (крови, суспензий свиной селезенки и черевы свиной, используемой при производстве колбасных изделий), содержащих вирус АЧС. Проверка стабильности показала резкое ухудшение качества работы одного набора в пределах срока годности, для другого набора выявлено существенное снижение уровня флуоресцентного сигнала при многократном замораживании – оттаивании. Сравнение сходимости результатов работы разных серий наборов одного производителя показало существенные расхождения для 41,5% наборов. Установлено, что лишь у 33% рассмотренных наборов для выявления ДНК вируса АЧС отсутствуют какие-либо недостатки. Результаты проведенной работы демонстрируют необходимость контроля выпускаемых диагностических наборов, используемых в государственных программах мониторинга заболеваний животных.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>The paper presents comparative test results of 12 domestically produced diagnostic kits/PCR test systems for DNA detection of the African swine fever virus with regard to the following parameters: completeness and correctness of instructions for use; labeling and package contents; convenience of using the kit; shelf life stability of reagents; stability of reagents after transportation and repeated freezing – thawing; batch-to-batch repeatability; sensitivity of various test materials and specificity of kits. The study of the instructions for use and kit contents revealed incompleteness of some instructions. It was noted that some manufacturers make serious errors in the instructions, which can significantly affect the interpretation of test results. It was also observed that there is insufficient control of the manufacturing process, which results in the production of faulty kits, as well as kits with poor-quality components and errors in the labeling. Thus, during the study, one kit showed its inactivity, demonstrating the absence of accumulation curves of the fluorescent signal during amplification of both positive controls and DNA of ASFV isolates. When the specificity was assessed, all the kits showed absence of non-specific reactions and acceptable sensitivity when testing various types of ASFV-containing material (blood, suspensions of pork spleen and pork casings used in sausage production). The stability test showed a sharp deterioration in the quality of operation of one kit within the shelf life period, and a significant decrease in the fluorescence signal was detected during repeated freeze – thaw cycles for another kit. Comparison of the repeatability results of different kit batches of the same manufacturer showed significant discrepancies for 41.5% of all kits. It was found that only 33% of the studied kits for ASFV DNA detection were compliant. The results of this study demonstrate the need for control of the manufactured diagnostic kits used in state programs for animal disease monitoring.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>ПЦР-тест-система</kwd><kwd>африканская чума свиней</kwd><kwd>чувствительность</kwd><kwd>специфичность</kwd><kwd>стабильность</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>PCR test system</kwd><kwd>African swine fever</kwd><kwd>sensitivity</kwd><kwd>specificity</kwd><kwd>stability</kwd></kwd-group><funding-group><funding-statement xml:lang="ru">Работа выполнена при поддержке Россельхознадзора в рамках научно-исследовательской работы по теме: «Изучение параметров качества отечественных и зарубежных диагностических ПЦР-наборов, применяемых в лабораторной ветеринарной практике на территории РФ, с целью разработки единых требований к параметрам качества и методам их контроля». Авторы выражают благодарность ФГБУ «ВНИИЗЖ» и ФГБНУ ФИЦВиМ за предоставленные образцы вируса АЧС.</funding-statement><funding-statement xml:lang="en">The study was carried out with the support of the Rosselkhoznadzor within the research work: “Study of quality parameters of domestic and foreign diagnostic PCR test kits used in laboratory veterinary practice in the Russian Federation in order to develop common requirements for quality parameters and methods of their control”. The authors express their gratitude to the FGBI “ARRIAH” and the FSBSI FRCVM for providing the ASF virus samples.</funding-statement></funding-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Эпизоотическая ситуация по АЧС в Российской Федера- ции в 2020 г. Режим доступа: https://fsvps.gov.ru/fsvps-docs/ru/iac/asf/2020/12-31/01.pdf (дата обращения: 02.01.2021).</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">ASF epidemic situation in the Russian Federation in 2020. [Epizooticheskaya situaciya po ACHS v Rossijskoj Federacii v 2020 g.]. Available at: https://fsvps.gov.ru/fsvps-docs/ru/iac/asf/2020/12-31/01.pdf (date of access 02.01.2021). (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Поляков И. В., Соколова Н. С. Практическое пособие по медицинской статистике. Л.: Медицина; 1975; 26–30.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Polyakov I. V., Sokolova N. S. Practical guide to medical statistics [Prakticheskoe posobie po medicinskoj statistike]. L.: Meditsyna; 1975; 26–30. (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Полякова В. В., Шаброва Н. В. Основы теории статистики: учебное пособие. 2-е изд., испр. и доп. Екатеринбург: Издательство Уральского университета; 2015. 145 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Polyakova V. V., Shabrova N. V. Fundamentals of the theory of statistics [Osnovy teorii statistiki]: Study Guide. 2nd ed., revised and updated. Yekaterinburg: Ural University Publishing House; 2015. 145 p. (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Sundar Rao P. S. S., Richard J. Introduction to biostatistics and research methods. 5th ed. New Delhi: PHI Learning Private Limited; 2012. 280 p.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Sundar Rao P. S. S., Richard J. Introduction to biostatistics and research methods. 5th ed. New Delhi: PHI Learning Private Limited; 2012. 280 p.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">МУ 1.3-2569-09 Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I–IV групп патогенности: методические указания. М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора; 2010. 51 с. Режим доступа: https://www.rospotrebnadzor.ru/documents/details.php?ELEMENT_ID=4801.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Methodical Guidelines 1.3-2569-09 Organization of laboratory activities using methods for amplification of nucleic acids and handling materials containing microorganisms of I–IV pathogenicity groups [MU 1.3-2569-09 Organizaciya raboty laboratorij, ispol’zuyushchih metody amplifikacii nukleinovyh kislot pri rabote s materialom, soderzhashchim mikroorganizmy I–IV grupp patogennosti]: Methodical Guidelines. M.: Federal Center for Hygiene and Epidemiology of Rospotrebnadzor; 2010. 51 p. Available at: https://www.rospotrebnadzor.ru/documents/details.php?ELEMENT_ID=4801. (in Russian).</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
