veterinaryВетеринария сегодняVeterinary Science Today2304-196X2658-6959"Veinard"10.29326/2304-196X-2020-1-32-44-50veterinary-457Research ArticleБОЛЕЗНИ ПТИЦAVIAN DISEASESГетерогенность вирусной популяции при инфекционном бронхите курHeterogeneity of avian infectious bronchitis virus populationhttps://orcid.org/0000-0001-5501-4432ОвчинниковаЕ. В.OvchinnikovaYe. V.

Овчинникова Евгения Валерьевна, кандидат биологических наук, научный сотрудник референтной лаборатории вирусных болезней птиц

600901, г. Владимир, мкр. Юрьевец

Yevgeniya V. Ovchinnikova, Candidate of Science (Biology), Researcher, Reference Laboratory for Avian Viral Diseases

600901, Vladimir, Yur’evets

ovchinnikova@arriah.ruhttps://orcid.org/0000-0001-5434-6179ЩербаковаЛ. О.ScherbakovaL. O.

Щербакова Лидия Олеговна, кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник референтной лаборатории вирусных болезней птиц

Владимир

Lidia O. Scherbakova, Candidate of Science (Biology), Leading Researcher, Reference Laboratory for Avian Viral Diseases

Vladimir

scherbakova@arriah.ruhttps://orcid.org/0000-0002-8467-180XКолосовС. Н.KolosovS. N.

Колосов Сергей Николаевич, кандидат биологических наук, сотрудник референтной лаборатории вирусных болезней птиц

Владимир

Sergey N. Kolosov, Candidate of Science (Biology), Researcher, Reference Laboratory for Avian Viral Diseases

Vladimir

kolosov@arriah.ruhttps://orcid.org/0000-0002-5335-3534АндриясоваА. Н.AndriyasovaA. N.

Андриясова Анна Николаевна, ведущий биолог референтной лаборатории вирусных болезней птиц

Владимир

Anna N. Andriyasova, Leading Biologist, Reference Laboratory for Avian Viral Diseases

Vladimir

andriyasova_an@arriah.ruhttps://orcid.org/0000-0002-3015-5594ЗиняковН. Г.ZinyakovN. G.

Зиняков Николай Геннадьевич, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник референтной лаборатории вирусных болезней птиц

Владимир

Nikolay G. Zinyakov, Candidate of Science (Biology), Senior Researcher, Reference Laboratory for Avian Viral Diseases

Vladimir

zinyakov@arriah.ruhttps://orcid.org/0000-0003-0090-9399НиконоваЗ. Б.NikonovaZ. B.

Никонова Зоя Борисовна, кандидат биологических наук, научный сотрудник референтной лаборатории вирусных болезней птиц

Владимир

Zoya B. Nikonova, Candidate of Science (Biology), Researcher, Reference Laboratory for Avian Viral Diseases

Vladimir

nikonova@arriah.ruhttps://orcid.org/0000-0002-1466-7602КозловА. А.KozlovA. A.

Козлов Антон Александрович, кандидат биологических наук, младший научный сотрудник референтной лаборатории вирусных болезней птиц

Владимир

Anton A. Kozlov, Candidate of Science (Biology), Junior Researcher, Reference Laboratory for Avian Viral Diseases

Vladimir

kozlov_aa@arriah.ruhttps://orcid.org/0000-0003-1520-1887АкшаловаП. Б.AkshalovaP. B.

Акшалова Перизат Батырханкызы, аспирант, сотрудник референтной лаборатории вирусных болезней птиц

Владимир

Perizat B. Akshalova, Post-Graduate Student, Researcher, Reference Laboratory for Avian Viral Diseases

Vladimir

akshalova@arriah.ruhttps://orcid.org/0000-0002-7510-9292АлтунинД. А.AltuninD. A.

Алтунин Дмитрий Александрович, ведущий биолог референтной лаборатории вирусных болезней птиц

Владимир

Dmitry A. Altunin, Leading Biologist, Reference Laboratory for Avian Viral Diseases

Vladimir

altunin@arriah.ruhttps://orcid.org/0000-0002-1681-5795АндрейчукД. Б.AndreychukD. B.

Андрейчук Дмитрий Борисович, кандидат биологических наук, заведующий референтной лабораторией вирусных болезней птиц

Владимир

Dmitry B. Andreychuk, Candidate of Science (Biology), Head of Reference Laboratory for Avian Viral Diseases

Vladimir

andreychuk@arriah.ruФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных» (ФГБУ «ВНИИЗЖ»)РоссияFGBI “Federal Centre for Animal Health”Russian Federation202027032020014450Copyright © Овчинникова Е.В., Щербакова Л.О., Колосов С.Н., Андриясова А.Н., Зиняков Н.Г., Никонова З.Б., Козлов А.А., Акшалова П.Б., Алтунин Д.А., Андрейчук Д.Б., 20202020Овчинникова Е.В., Щербакова Л.О., Колосов С.Н., Андриясова А.Н., Зиняков Н.Г., Никонова З.Б., Козлов А.А., Акшалова П.Б., Алтунин Д.А., Андрейчук Д.Б.Ovchinnikova Y.V., Scherbakova L.O., Kolosov S.N., Andriyasova A.N., Zinyakov N.G., Nikonova Z.B., Kozlov A.A., Akshalova P.B., Altunin D.A., Andreychuk D.B.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://veterinary.arriah.ru/jour/article/view/457

Инфекционный бронхит кур является одной из наиболее распространенных вирусных инфекций, наносящих огромный экономический ущерб птицевод­ству во всем мире. По причине отсутствия механизмов коррекции во время репликации генома вирус может быстро мутировать и генерировать новые штаммы. Этому способствует широкое использование живых вакцин, одновременная циркуляция полевых вирусов, относящихся к разным серотипам в одном стаде, и быстрое распространение вируса. Проведенные ранее исследования выявленных на птицефабриках Российской Федерации штаммов и изолятов вируса инфекционного бронхита кур показали, что 50% положительных проб относятся к вакцинным штаммам 4-91, D274, Н-120, Ма5, вторая половина положительных проб представлена полевыми вирусами, которые относятся к 8 генетическим линиям генотипа GI, при этом доминирующей является линия G1-19 (QX). В данной работе представлены результаты по выявлению и генотипированию вируса инфекционного бронхита кур на одной из птицефабрик Саратовской области Российской Федерации в 2018–2019 гг. Внутренние органы, ротоглоточные и клоакальные смывы, кровь отбирали от цыплят и кур-несушек разных возрастов из родительского стада и стада ремонтного молодняка. Выявлены: вакцинный штамм, полевые изоляты генетической линии GI-19 и вариантные изоляты, не относящиеся ни к одной из известных генетических линий. Анализ результатов исследований за двухлетний период показал, что важно исследовать пробы, взятые от птиц разного возраста. Инфицируя несколько поколений птиц, вирус изменяется и приспосабливается, порождая новые генетические формы, благодаря чему наблюдается гетерогенность вирусной популяции не только на птицефа­брике в целом или в отдельном цехе, но и в одном организме. Выявленные изоляты обладали тропизмом к тканям кишечника, репродуктивных органов и, в единичных случаях, трахеи и легких. Полученные данные свидетельствуют о том, что на птицефабрике, несмотря на применяемую вакцинацию, циркулирует генетически разнородная популяция вируса инфекционного бронхита, при этом инфекция может не проявляться в раннем возрасте, но может повлиять на продуктивность стада в дальнейшем за счет патологических изменений органов репродукции кур-несушек.

Avian infectious bronchitis is one of the most common viral infections causing enormous economic losses in the global poultry industry. Due to the lack of mechanisms to correct errors during genome replication, the virus can quickly mutate and generate new strains. This is facilitated by widespread use of live vaccines, simultaneous circulation of field viruses belonging to different serotypes in one flock and rapid spread of the virus. Previous studies of avian infectious bronchitis virus strains and isolates identified in the Russian Federation poultry farms showed that 50% of samples tested positive for the 4-91, D274, H-120, Ma5 vaccine strains, and the other half of samples tested positive for the field viruses belonging to eight GI genetic lineages, while the G1-19 (QX) lineage was dominant. The paper presents identification and genotyping results of the avian infectious bronchitis virus in one of the poultry farms in the Saratov Oblast (the Russian Federation) in 2018–2019. The samples of internal organs and blood, as well as oropharyngeal and cloacal swabs were taken from chicks and layers of different ages in the parent and replacement flocks. The vaccine strain, GI-19 field isolates and variant isolates that do not belong to any of the known genetic lineages were detected. Analysis of test results within a two-year period showed that it is important to study samples taken from birds of different ages. The virus undergoes modification and adaptation inducing new genetic forms by infecting several poultry generations, due to which the heterogeneity of the virus population is ob­served not only in the poultry farm as a whole or in a separate department, but also within one organism. The identified isolates showed tropism for the tissues of intestine, reproductive organs, and, in rare cases, trachea and lungs. The data obtained indicate that, despite the vaccination used, a genetically diverse population of the infectious bronchitis virus circulates in the poultry farm, while the infection may not manifest itself at an early age, but may affect the flock productivity in the future due to pathological changes in the reproductive organs of laying chickens.

вирус инфекционного бронхита кургенетический анализгенетическая линиягетерогенность вирусной популяцииavian infectious bronchitis virusgenetic analysisgenetic lineagevirus population heterogeneityReferencesSjaak de Wit J. J., Cook J. K., van der Heijden H. M. Infectious bronchitis virus variants: a review of the history, current situation and control measures. Avian Pathol. 2011; 40 (3): 223–235. DOI: 10.1080/03079457.2011.566260.Sjaak de Wit J. J., Cook J. K., van der Heijden H. M. Infectious bronchitis virus variants: a review of the history, current situation and control measures. Avian Pathol. 2011; 40 (3): 223–235. DOI: 10.1080/03079457.2011.566260.Bande F., Arshad S. S., Bejo M. H., Moeini H., Omar A. R. Progress and challenges toward the development of vaccines against avian infectious bronchitis. J. Immunol. Res. 2015; 2015:424860. DOI: 10.1155/2015/424860.Bande F., Arshad S. S., Bejo M. H., Moeini H., Omar A. R. Progress and challenges toward the development of vaccines against avian infectious bronchitis. J. Immunol. Res. 2015; 2015:424860. DOI: 10.1155/2015/424860.Щербакова Л. О., Колосов С. Н., Никонова З. Б., Зиняков Н. Г., Овчинникова Е. В., Чвала И. А. Генетическая характеристика изолятов вируса инфекционного бронхита кур, выявленных на территории стран СНГ в 2015–2017 гг. Ветеринария сегодня. 2018; 3: 30–39. DOI: 10.29326/2304-196X-2018-3-26-30-34.Scherbakova L. O., Kolosov S. N., Nikonova Z. B., Zinyakov N. G., Ovchinnikova Ye. V., Chvala I. A. Genetic characterization of avian infectious bronchitis virus isolates recovered in CIS countries in 2015–2017. Veterinary Science Today. 2018; 3: 30–39. DOI: 10.29326/2304-196X-2018-3-26-30-34. (in Russian)Jackwood M. W., de Wit S. Infectious bronchitis. In: Swayne D. E., Glisson J. R., McDougald L. R., Nolan L. K., Suarez D. L., Nair V. (eds.). Diseases of Poultry. 13th ed. Ames: Wiley-Blackwell Publishing, 2013; 139–160.Jackwood M. W., de Wit S. Infectious bronchitis. In: Swayne D. E., Glisson J. R., McDougald L. R., Nolan L. K., Suarez D. L., Nair V. (eds.). Diseases of Poultry. 13th ed. Ames: Wiley-Blackwell Publishing, 2013; 139–160.Bande F., Arshad S. S., Omar A. R., Bejo M. H., Abubakar M. S., Abba Y. Pathogenesis and diagnostic approaches of avian infectious bronchitis. Adv. Virol. 2016; 2016:4621659. DOI: 10.1155/2016/4621659.Bande F., Arshad S. S., Omar A. R., Bejo M. H., Abubakar M. S., Abba Y. Pathogenesis and diagnostic approaches of avian infectious bronchitis. Adv. Virol. 2016; 2016:4621659. DOI: 10.1155/2016/4621659.Terregino C., Toffan A., Beato M. S., De Nardi R., Vascellari M., Meini A., Ortali G., Mancin M., Capua I. Pathogenicity of a QX strain of infectious bronchitis virus in specific pathogen free and commercial broiler chickens, and evaluation of protection induced by a vaccination programme based on the MA5 and 4/91 serotypes. Avian Pathol. 2008; 37 (5): 487–493. DOI: 10.1080/03079450802356938.Terregino C., Toffan A., Beato M. S., De Nardi R., Vascellari M., Meini A., Ortali G., Mancin M., Capua I. Pathogenicity of a QX strain of infectious bronchitis virus in specific pathogen free and commercial broiler chickens, and evaluation of protection induced by a vaccination programme based on the MA5 and 4/91 serotypes. Avian Pathol. 2008; 37 (5): 487–493. DOI: 10.1080/03079450802356938.Овчинникова Е. В., Зиняков Н. Г., Беляков С. В., Дрыгин В. В. Вирус инфекционного бронхита кур генотипа QX. Изучение молекулярно-биологических и патогенных свойств. IV Международный ветеринарный конгресс: материалы конф. «Актуальные ветеринарные проблемы в промышленном птицеводстве». Казань; 2014.Ovchinnikova Ye. V., Zinyakov N. G., Belyakov S. V., Drygin V. V. QX genotype avian infectious bronchitis virus. Study of molecular, biological and pathogenic properties [Virus infekcionnogo bronhita kur genotipa QX. Izuchenie molekulyarno-biologicheskih i patogennyh svojstv]. IV International Veterinary Congress: conference proceedings “Current veterinary issues in poultry industry”. Kazan; 2014. (in Russian)Бочков Ю. А., Дрыгин В. В., Борисов A. B., Гусев А. А., Смоленский В. И. Индикация генома вируса инфекционного бронхита кур с помощью полимеразной цепной реакции. Современные аспекты ветеринарной патологии животных: материалы конф. (23–25 ноября 1998 г.). Владимир; 1998: 173–183.Bochkov Yu. A., Drygin V. V., Borisov A. V., Gusev A. A., Smolenskiy V. I. Indication of avian infectious bronchitis virus genome using polymerase chain reaction [Indikaciya genoma virusa infekcionnogo bronhita kur s pomoshch’yu polimeraznoj cepnoj reakcii]. Current issues in veterinary pathology: conference proceedings [Sovremennye aspekty veterinarnoj patologii zhivotnyh] (November 23–25, 1998 ). Vladimir; 1998: 173–183. (in Russian)Овчинникова Е. В., Щербакова Л. О., Андриясов А. В., Борисов А. В., Мудрак Н. С. Методические указания по выявлению генома вируса инфекционного бронхита кур с использованием полимеразной цепной реакции в режиме реального времени: утв. ФГБУ «ВНИИЗЖ» 05.02.2010. Владимир; 2010; 10 с.Ovchinnikova Ye. V., Scherbakova L. О., Andriyasov A. V., Borisov A. V., Mudrak N. S. Guidelines for identification of avian infectious bronchitis virus genome using real-time polymerase chain reaction [Metodicheskie ukazaniya po vyyavleniyu genoma virusa infekcionnogo bronhita kur s ispol’zovaniem polimeraznoj cepnoj reakcii v rezhime real’nogo vremeni]: approved by FGBI “ARRIAH” 05.02.2010. Vladimir; 2010; 10 p. (in Russian)Valastro V., Holmes E. C., Britton P., Fusaro A., Jackwood M. W., Cattoli G., Monne I. S1 gene-based phylogeny of infectious bronchitis virus: An attempt to harmonize virus classification. Infect. Genet. Evol. 2016; 39: 349–364. DOI: 10.1016/j.meegid.2016.02.015.Valastro V., Holmes E. C., Britton P., Fusaro A., Jackwood M. W., Cattoli G., Monne I. S1 gene-based phylogeny of infectious bronchitis virus: An attempt to harmonize virus classification. Infect. Genet. Evol. 2016; 39: 349–364. DOI: 10.1016/j.meegid.2016.02.015.McKinley E. T., Hilt D. A., Jackwood M. W. Avian coronavirus infectious bronchitis attenuated live vaccines undergo selection of subpopulations and mutations following vaccination. Vaccine. 2008; 26 (10): 1274–1284. DOI: 10.1016/j.vaccine.2008.01.006.McKinley E. T., Hilt D. A., Jackwood M. W. Avian coronavirus infectious bronchitis attenuated live vaccines undergo selection of subpopulations and mutations following vaccination. Vaccine. 2008; 26 (10): 1274–1284. DOI: 10.1016/j.vaccine.2008.01.006.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.