veterinaryВетеринария сегодняVeterinary Science Today2304-196X2658-6959"Veinard"veterinary-234Research ArticleБОЛЕЗНИ ПТИЦAVIAN DISEASESАнализ последовательности полного генома штамма «О» вируса инфекционного ларинготрахеита птицAnalysis of whole genome sequence of strain "0" of avian infectious laryngotracheitis virusКозловА. А.KozlovA. A.a.mr.seven@mail.ruЗиняковН. Г.ZinyakovN. G.zinyakov@arriah.ruКолосовС. Н.KolosovS. N.kolosov@arriah.ruМудракН. С.MudrakN. S.mudrak@arriah.ruЧвалаИ. А.ChvalaI. A.chvala@arriah.ruФГБУ «ВНИИЗЖ», г. ВладимирРоссияFGBI "ARRIAH", VladimirRussian Federation201602042018015558Copyright © Козлов А.А., Зиняков Н.Г., Колосов С.Н., Мудрак Н.С., Чвала И.А., 20182018Козлов А.А., Зиняков Н.Г., Колосов С.Н., Мудрак Н.С., Чвала И.А.Kozlov A.A., Zinyakov N.G., Kolosov S.N., Mudrak N.S., Chvala I.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://veterinary.arriah.ru/jour/article/view/234

Представлены данные по определению и анализу нуклеотидной последовательности полного генома штамма «О» вируса инфекционного ларинготрахеита птиц. В ходе картирования нуклеотидной последовательности полного генома выявлен ряд уникальных значимых нуклеотидных особенностей в генах, кодирующих поверхностные белки, ответственные за взаимодействие с клеточными рецепторами. Показана принадлежность штамма «О» к филогенетической группе 1, подгруппе 1 (1.1). В ходе работы установлено генетическое родство отечественного вакцинного штамма «О» с другими широко используемыми вакцинными штаммами в мировом птицеводстве, такими KaKServa, Cover, Hudson и Fowl laryngo. Картированная нуклеотидная последовательность депонирована в международную базу данных GenBank под номером KU128407 и является первой полной генетической характеристикой отечественного вакцинного штамма.

Data on identification and analysis of whole genome nucleotide sequence of strain «O» of avian infectious laryngotracheitis virus are demonstrated. In the process of the whole genome sequence mapping a number of unique and significant nucleotide properties has been identified in genes that code surface proteins responsible for interacting with cell receptors. Strain «O» has been demonstrated to belong to phylogenetic group 1 subgroup 1 (1.1). Genetic relatedness of domestic strain «0» to other vaccine strains widely used in global poultry industry such as Serva, Cover, Hudson and Fowl laryngo has been determined. The mapped nucleotide sequence has been deposited in the international GenBank database under the accession number KU128407. It is the first complete genetic characterization of the domestic vaccine strain.

вирус инфекционного ларинготрахеитаполногеномное секвенированиепоследовательность полного геномакартирование геномафилогенетический анализinfectious laryngortacheitis viruswhole genome sequencingwhole genome sequencegene mappingphylogenetic analysisReferencesОчистка и концентрирование вируса инфекционного ларинготрахеита птиц / A.A. Козлов, Д.Б. Андрейчук, А.Н. Андриясова, Н.С. Мудрак // Инновационное развитие науки в обеспечении биологической безопасности: сб. материалов 2-й Междунар. науч. конф. молодых ученых. - Гвардейский, Казахстан, 2014. - С. 125-128.Очистка и концентрирование вируса инфекционного ларинготрахеита птиц / A.A. Козлов, Д.Б. Андрейчук, А.Н. Андриясова, Н.С. Мудрак // Инновационное развитие науки в обеспечении биологической безопасности: сб. материалов 2-й Междунар. науч. конф. молодых ученых. - Гвардейский, Казахстан, 2014. - С. 125-128.Пат. 2207372 Российская Федерация, МПК7 C12N 7/00. Штамм «О» вируса инфекционного ларинготрахеита птиц для изготовления диагностических и вакцинных препаратов / A.B. Бочарников, В.Ю. Кулаков, A.B. Борисов [и др.]; ФГУ «ВНИИЗЖ». - № 2002105552/13; заявл. 28.02.2002; опубл. 27.06.2003.Пат. 2207372 Российская Федерация, МПК7 C12N 7/00. Штамм «О» вируса инфекционного ларинготрахеита птиц для изготовления диагностических и вакцинных препаратов / A.B. Бочарников, В.Ю. Кулаков, A.B. Борисов [и др.]; ФГУ «ВНИИЗЖ». - № 2002105552/13; заявл. 28.02.2002; опубл. 27.06.2003.Attenuated vaccines can recombine to form virulent field viruses / S.W. Lee, P.F. Markham, M.J. Coppo [et al.] // Science. - 2012. - Vol. 337, № 6091. - P. 188.Attenuated vaccines can recombine to form virulent field viruses / S.W. Lee, P.F. Markham, M.J. Coppo [et al.] // Science. - 2012. - Vol. 337, № 6091. - P. 188.Complete genome sequence of the first Chinese virulent infectious laryngotracheitis virus / C. Kong, Y. Zhao, X. Cui [et al.] // PLoS ONE. - 2013. - Vol. 8, № 7. - URL: http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0070154.Complete genome sequence of the first Chinese virulent infectious laryngotracheitis virus / C. Kong, Y. Zhao, X. Cui [et al.] // PLoS ONE. - 2013. - Vol. 8, № 7. - URL: http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0070154.Genomic sequence analysis of the United States infectious laryngotracheitis vaccine strains chicken embryo origin (CEO) and tissue culture origin (TCO) / M. Garcia, V. Volkening, S.M. Riblet [et al.] // Virology. - 2013. - Vol. 440. - P. 64-74.Genomic sequence analysis of the United States infectious laryngotracheitis vaccine strains chicken embryo origin (CEO) and tissue culture origin (TCO) / M. Garcia, V. Volkening, S.M. Riblet [et al.] // Virology. - 2013. - Vol. 440. - P. 64-74.Molecular epidemiology of infectious laryngotracheitis: a review / K.R. Menendez, M. Garcia, S. Spatz, N.L. Tablante // Avian Pathology. - 2014. - Vol. 43, № 2. - P. 108-117.Molecular epidemiology of infectious laryngotracheitis: a review / K.R. Menendez, M. Garcia, S. Spatz, N.L. Tablante // Avian Pathology. - 2014. - Vol. 43, № 2. - P. 108-117.Phylogenetic and molecular epidemiological studies reveal evidence of multiple past recombination events between infectious laryngotracheitis viruses / S.W. Lee, J.M. Devlin, J.F. Markham [et al.] // PLoS ONE. - 2013, - Vol. 8, № 2. - URL: http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0055121.Phylogenetic and molecular epidemiological studies reveal evidence of multiple past recombination events between infectious laryngotracheitis viruses / S.W. Lee, J.M. Devlin, J.F. Markham [et al.] // PLoS ONE. - 2013, - Vol. 8, № 2. - URL: http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0055121.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.