<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">veterinary</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Ветеринария сегодня</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Veterinary Science Today</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2304-196X</issn><issn pub-type="epub">2658-6959</issn><publisher><publisher-name>"Veinard"</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">veterinary-204</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>БОЛЕЗНИ КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>CATTLE DISEASES</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Молекулярная эпизоотология ящура в России (филогенетический анализ российских изолятов вируса ящура)</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>FMD molecular epizootology in Russia (phylogenetic analysis *^ß of Russian FMDV isolates)</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Щербаков</surname><given-names>А. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Scherbakov</surname><given-names>A. V.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">ascherbakov@arriah.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff xml:lang="ru" id="aff-1"><institution>ФГБУ «ВНИИЗЖ», г. Владимир</institution><country>Russian Federation</country></aff><pub-date pub-type="collection"><year>2015</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>02</day><month>04</month><year>2018</year></pub-date><volume>0</volume><issue>3</issue><fpage>30</fpage><lpage>36</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Щербаков А.В., 2018</copyright-statement><copyright-year>2018</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Щербаков А.В.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Scherbakov A.V.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://veterinary.arriah.ru/jour/article/view/204">https://veterinary.arriah.ru/jour/article/view/204</self-uri><abstract><p>В статье обобщены результаты 20-летних молекулярно-эпизоотологических исследований ящура в России. Филогенетический анализ российских изолятов вируса ящура доказывает, что все вспышки ящура в Российской Федерации в 1995-2014 гг. были вызваны заносом болезни из других стран, главным образом из Китая. Показано, что в разные годы происходил занос в Россию разных генетических линий/штаммов вируса ящура: 1995 г. - 0/САТН AY, 2000 и 2004 гг. - O/ME-SA/PanAsia, 2005-2006 гг. - Asial, 2010-2011 гг. - O/SEA/Mea-98,2012 г.- О/ME-SA/ PanAsia, 2013 г. - A/ASIA/lran-05 и A/ASIA/Sea-97,2014 г. - A/ASIA/Sea-97, O/ME-SA/PanAsia и O/SEA/Mea-98. Большинство вспышек, зарегистрированных в Забайкалье и на Дальнем Востоке Российской Федерации, представляли собой продолжение панзоотий ящура, имеющих один и тот же путь распространения: из стран Юго-Восточной Азии в Китай и далее в Россию.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>The paper sums up the results of 20-year-long FMD molecular and epizootological studies in Russia. Phylogenetic analyses of the Russian FMDV isolates are indicative of the fact that all FMD outbreaks in the Russian Federation in 1995-2014 were due to the virus introduction from other countries, mainly from China. It was demonstrated that in different years FMDV of different genetic lineages/ strains was introduced into Russia, i.e. 1995 - O/CATHAY, 2000 and 2004 - O/ME-SA/PanAsia, 2005-2006 - Asial, 2010-2011 - O/SEA/Mea-98,2012 - O/ME-SA/PanAsia, 2013 - A/ASIA/lran-05 and A/ASIA/Sea-97, 2014 - A/ASIA/Sea-97, O/ME-SA/PanAsia and O/SEA/Mea-98. The majority of the outbreaks reported in the Zabaikalsky Krai and Far East of the Russian Federation were associated with FMD panzootics having the same route of spread: from Southeast Asian countries to China and hereafter to Russia.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>вирус ящура</kwd><kwd>филогенетический анализ</kwd><kwd>foot and mouth disease virus (FMDV)</kwd><kwd>phylogenetic analysis</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Молекулярная эпизоотология ящура в России и странах СНГ / A.B. Щербаков, В.Г. Андреев, В.В. Дрыгин, A.A. Гусев // Аграрная Россия. - 2002 - № 2. - С. 8-11.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Молекулярная эпизоотология ящура в России и странах СНГ / A.B. Щербаков, В.Г. Андреев, В.В. Дрыгин, A.A. Гусев // Аграрная Россия. - 2002 - № 2. - С. 8-11.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Филогенетический анализ российских изолятов вируса ящура / A.B. Щербаков, А.М. Тимина, A.C. Яковлева, В.В. Дрыгин, В.М. Захаров // Тр. Федерального центра охраны здоровья животных. - Владимир, 2006. - Т. 4. - С. 20-25.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Филогенетический анализ российских изолятов вируса ящура / A.B. Щербаков, А.М. Тимина, A.C. Яковлева, В.В. Дрыгин, В.М. Захаров // Тр. Федерального центра охраны здоровья животных. - Владимир, 2006. - Т. 4. - С. 20-25.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Щербаков A.B., Перевозчикова H.A., Дрыгин В.В. Методические указания по индикации генома и штаммовой дифференциации вируса ящура методом полимеразной цепной реакции и секвенированием гена VP1 // Методические указания по диагностике заболеваний сельскохозяйственных животных методом полимеразной цепной реакции. - Владимир, Ί 998. - С. 31-41.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Щербаков A.B., Перевозчикова H.A., Дрыгин В.В. Методические указания по индикации генома и штаммовой дифференциации вируса ящура методом полимеразной цепной реакции и секвенированием гена VP1 // Методические указания по диагностике заболеваний сельскохозяйственных животных методом полимеразной цепной реакции. - Владимир, Ί 998. - С. 31-41.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Щербаков A.B., Тимина А.М. Филогенетический анализ изолятов вируса ящура, вызвавших вспышки болезни в России и Монголии в 2010 г.//Тр. Федерального центра охраны здоровья животных. - Владимир, 2011, -Т. 9, -С. 5-11.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Щербаков A.B., Тимина А.М. Филогенетический анализ изолятов вируса ящура, вызвавших вспышки болезни в России и Монголии в 2010 г.//Тр. Федерального центра охраны здоровья животных. - Владимир, 2011, -Т. 9, -С. 5-11.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Щербаков A.B., Тимина А.М., Зиняков Н.Г. Филогенетический анализ изолятов вируса ящура, вызвавших вспышки болезни в России в 2013 году// Ветеринария. - 2014. - № 7. - С. 22-25.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Щербаков A.B., Тимина А.М., Зиняков Н.Г. Филогенетический анализ изолятов вируса ящура, вызвавших вспышки болезни в России в 2013 году// Ветеринария. - 2014. - № 7. - С. 22-25.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Эпизоотическая ситуация по ящуру типа Азия-1 в России в 2005 году и анализ эффективности мер борьбы / К.Н. Груздев, Т.З. Байбиков, В.Н. Герасимов [и др.] // Тр. Федерального центра охраны здоровья животных. - Владимир, 2006. - Т. 4. - С. 3-19.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Эпизоотическая ситуация по ящуру типа Азия-1 в России в 2005 году и анализ эффективности мер борьбы / К.Н. Груздев, Т.З. Байбиков, В.Н. Герасимов [и др.] // Тр. Федерального центра охраны здоровья животных. - Владимир, 2006. - Т. 4. - С. 3-19.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Application of RT-PCR and nucleotide sequencing in foot-and-mouth disease diagnosis / A. Sherbakov, N. Lomakina, V. Drygin, A. Gusev //The Veterinary Quarterly. - 1998. - Vol. 20, № 2. - P. 32-34.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Application of RT-PCR and nucleotide sequencing in foot-and-mouth disease diagnosis / A. Sherbakov, N. Lomakina, V. Drygin, A. Gusev //The Veterinary Quarterly. - 1998. - Vol. 20, № 2. - P. 32-34.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Beard C.W., Mason P.W. Genetic determinants of altered virulence ofTaiwanese foot-and-mouth disease virus // J. Virol. - 2000 - Vol. 74, № 2. - P. 987-991.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Beard C.W., Mason P.W. Genetic determinants of altered virulence ofTaiwanese foot-and-mouth disease virus // J. Virol. - 2000 - Vol. 74, № 2. - P. 987-991.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Beck E., Strohmaier К. Subtyping of european foot-and-mouth disease virus strains by nucleotide sequence determination //J.Virol. - 1987. - Vol. 61. - P. 1621-1629.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Beck E., Strohmaier К. Subtyping of european foot-and-mouth disease virus strains by nucleotide sequence determination //J.Virol. - 1987. - Vol. 61. - P. 1621-1629.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Comparative sequence analysis of representative foot-and-mouth disease virus genomes from Southeast Asia / N.F. Abdul-Hamid, M. Firat-Saraç, A.D. Radford [et al.] // Virus Genes. - 2011. - Vol. 43, №1, -P. 41-45.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Comparative sequence analysis of representative foot-and-mouth disease virus genomes from Southeast Asia / N.F. Abdul-Hamid, M. Firat-Saraç, A.D. Radford [et al.] // Virus Genes. - 2011. - Vol. 43, №1, -P. 41-45.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Emergence of a pandemic strain of foot-and-mouth disease virus serotype О / N.J. Knowles, A.R. Samuel, P.R. Davies [et al.] // European Commission for the control of FMD. Session of the Research Group of the Standing Technical Committee Borovets, Bulgaria, 5-8 September, 2000. - P. 20-31.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Emergence of a pandemic strain of foot-and-mouth disease virus serotype О / N.J. Knowles, A.R. Samuel, P.R. Davies [et al.] // European Commission for the control of FMD. Session of the Research Group of the Standing Technical Committee Borovets, Bulgaria, 5-8 September, 2000. - P. 20-31.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Genetic basis of antigenic variation in foot-and-mouth disease serotype A viruses from the Middle East / S. Upadhyaya, G. Ayelet, G. Paul [et al.] // Vaccine. - 2014, - Vol. 32, № 5. - P. 631-638.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Genetic basis of antigenic variation in foot-and-mouth disease serotype A viruses from the Middle East / S. Upadhyaya, G. Ayelet, G. Paul [et al.] // Vaccine. - 2014, - Vol. 32, № 5. - P. 631-638.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Knowles N.J., Samuel A.R. Molecular epidemiology of foot-and-mouth disease virus //Virus Res. - 2003. - Vol. 91, № 1, -P. 65-80.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Knowles N.J., Samuel A.R. Molecular epidemiology of foot-and-mouth disease virus //Virus Res. - 2003. - Vol. 91, № 1, -P. 65-80.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Preliminary molecular analysis of FMD virus isolates collected on territories of Russia and the CIS in 1993-1994 / V.V. Drygin, A.V. Scherbakov, N.A. Perevozchikova, A.A. Gusev// Europ. Commiss. FMD. Vienna. Austria, 19-22 September 1994. - Rome, 1994. - P. 8.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Preliminary molecular analysis of FMD virus isolates collected on territories of Russia and the CIS in 1993-1994 / V.V. Drygin, A.V. Scherbakov, N.A. Perevozchikova, A.A. Gusev// Europ. Commiss. FMD. Vienna. Austria, 19-22 September 1994. - Rome, 1994. - P. 8.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit15"><label>15</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Recent spread of a new strain (A-lran-05) of foot-and-mouth disease virus type A in the Middle East / N.J. Knowles, M.H. Nazem Shirazi, J. Wadsworth [et al.] // Transbound Emerg Dis. - 2009.-Vol. 56, №5. -P. 157- 169.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Recent spread of a new strain (A-lran-05) of foot-and-mouth disease virus type A in the Middle East / N.J. Knowles, M.H. Nazem Shirazi, J. Wadsworth [et al.] // Transbound Emerg Dis. - 2009.-Vol. 56, №5. -P. 157- 169.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit16"><label>16</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Recent spread of FMD virus serotype Asia 1 / J.F. Valarcher, N.J. Knowles, N.P. Ferris [et al.] // Vet. Record. - 2005. - July 2. - P. 30.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Recent spread of FMD virus serotype Asia 1 / J.F. Valarcher, N.J. Knowles, N.P. Ferris [et al.] // Vet. Record. - 2005. - July 2. - P. 30.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit17"><label>17</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Samuel A.R., Knowles N.J. / Foot-and-mouth disease type О viruses exhibit genetically and geographically distinct evolutionary lineages (topotypes) //J. Gen. Virol. - 2001. - Vol. 82, № 3. - P. 609-621.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Samuel A.R., Knowles N.J. / Foot-and-mouth disease type О viruses exhibit genetically and geographically distinct evolutionary lineages (topotypes) //J. Gen. Virol. - 2001. - Vol. 82, № 3. - P. 609-621.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit18"><label>18</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">http://www.foot-and-mouth.org.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">http://www.foot-and-mouth.org.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit19"><label>19</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">http://www.oie.int/wahis_2/public/wahid.php/ Diseaseinformation.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">http://www.oie.int/wahis_2/public/wahid.php/ Diseaseinformation.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit20"><label>20</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">http://www.wrlfmd.org/fmd_genotyping.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">http://www.wrlfmd.org/fmd_genotyping.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
