veterinaryВетеринария сегодняVeterinary Science Today2304-196X2658-6959"Veinard"10.29326/2304-196X-2026-15-3-280-289veterinary-1041Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ | ВЕТЕРИНАРНАЯ МИКРОБИОЛОГИЯORIGINAL ARTICLES | VETERINARY MICROBIOLOGYРазработка ПЦР-тест-систем для оценки распространенности генов антибиотикорезистентности у клостридийDevelopment of PCR test systems for assessment of antibiotic resistance gene prevalence in Clostridium spp.https://orcid.org/0000-0003-2793-5001БезбородоваН. А.BezborodovaN. A.

Безбородова Наталья Александровна, канд. вет. наук, старший научный сотрудник отдела геномных исследований и селекции животных

ул. Белинского, 112а, г. Екатеринбург, 620142

Natalia A. Bezborodova, Cand. Sci. (Veterinary Medicine), Senior Researcher, Department of Animal Genomics and Selection, Ural Federal Agrarian Scientific Research Center

ul. Belinskogo, 112а, Ekaterinburg 620142

n-bezborodova@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0003-3538-8749ГлотоваТ. И.GlotovaT. I.

Глотова Татьяна Ивановна, д-р биол. наук, профессор, главный научный сотрудник лаборатории биотехнологии – диагностического центра

 р. п. Краснообск, 630501, Новосибирская область

Tatyana I. Glotova, Dr. Sci. (Biology), Professor, Chief Researcher,  Laboratory of Biotechnology – Diagnostic Center, Siberian  Federal Scientific Centre of Agro-BioTechnologies

 Krasnoobsk 630501, Novosibirsk Oblast

t-glotova@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-1169-4090СоколоваО. В.SokolovaO. V.

Соколова Ольга Васильевна, д-р вет. наук, ведущий научный сотрудник отдела геномных исследований и селекции животных, руководитель Уральского научно-исследовательского ветеринарного института – структурного подразделения

ул. Белинского, 112а, г. Екатеринбург, 620142

Olga V. Sokolova, Dr. Sci. (Veterinary Medicine), Leading  Researcher, Department of Animal Genomics and Selection, Head of Ural Scientific Research Veterinary Institute, Ural Federal Agrarian Scientific Research Center

ul. Belinskogo, 112а, Ekaterinburg 620142

nauka_sokolova@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0003-0025-3545ШкуратоваИ. А.ShkuratovaI. A.

Шкуратова Ирина Алексеевна, д-р вет. наук, профессор, член-корреспондент РАН, главный научный сотрудник отдела экологии и незаразной патологии животных

ул. Белинского, 112а, г. Екатеринбург, 620142

Irina A. Shkuratova, Dr. Sci. (Veterinary Medicine), Professor, Corresponding Member of the Russian Academy of Sciences, Chief Researcher, Department of Ecology and Animals’ Noncontagious Pathology

ul. Belinskogo, 112а, Ekaterinburg 620142

shkuratova@bk.ruhttps://orcid.org/0000-0003-0284-0276ЗубареваВ. Д.ZubarevaV. D.

Зубарева Владлена Дмитриевна, младший научный сотрудник отдела геномных исследований и селекции животных

ул. Белинского, 112а, г. Екатеринбург, 620142

Vladlena D. Zubareva, Junior Researcher, Department of Animal Genomics and Selection, Ural Federal Agrarian Scientific Research Center

ul. Belinskogo, 112а, Ekaterinburg 620142

zzub97@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-9251-0056МартыновН. А.MartynovN. A.

Мартынов Николай Александрович, лаборант отдела геномных исследований и селекции животных

ул. Белинского, 112а, г. Екатеринбург, 620142

Nikolai A. Martynov, Laboratory Assistant, Department of Animal Genomics and Selection, Ural Federal Agrarian Scientific Research Center

ul. Belinskogo, 112а, Ekaterinburg 620142

martynov_kolya98@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0006-4980-0481РомановЕ. В.RomanovE. V.

Романов Егор Владимирович, младший научный сотрудник отдела ветеринарно-лабораторной диагностики с испытательной лабораторией

ул. Белинского, 112а, г. Екатеринбург, 620142

Egor V. Romanov, Junior Researcher, Department of Veterinary and Laboratory Diagnosis and Testing Laboratory, Ural Federal Agrarian Scientific Research Center

ul. Belinskogo, 112а, Ekaterinburg 620142

romanov.egor.2303@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0002-2006-0196ГлотовА. Г.GlotovA. G.

Глотов Александр Гаврилович, д-р вет. наук, профессор, член-корреспондент РАН, руководитель ИЭВСиДВ

 р. п. Краснообск, 630501, Новосибирская область

Alexander G. Glotov, Dr. Sci. (Veterinary Medicine), Professor, Corresponding Member of the RAS, Head of the Institute of Experimental Veterinary Science of Siberia and the Far East

 Krasnoobsk 630501, Novosibirsk Oblast

glotov_vet@mail.ruФГБНУ «Уральский федеральный аграрный научно-исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук» (ФГБНУ УрФАНИЦ УрО РАН)РоссияUral Federal Agrarian Scientific Research Center, Ural Branch of the Russian Academy of SciencesRussian FederationФГБУН «Сибирский федеральный научный центр агробиотехнологий Российской академии наук», Институт экспериментальной ветеринарии Сибири и Дальнего Востока (ИЭВСиДВ СФНЦА РАН)РоссияSiberian Federal Scientific Centre of Agro-BioTechnologies of the Russian Academy of Sciences, Institute of Experimental Veterinary Science of Siberia and the Far EastRussian Federation202623092026153280289Copyright © Безбородова Н.А., Глотова Т.И., Соколова О.В., Шкуратова И.А., Зубарева В.Д., Мартынов Н.А., Романов Е.В., Глотов А.Г., 20262026Безбородова Н.А., Глотова Т.И., Соколова О.В., Шкуратова И.А., Зубарева В.Д., Мартынов Н.А., Романов Е.В., Глотов А.Г.Bezborodova N.A., Glotova T.I., Sokolova O.V., Shkuratova I.A., Zubareva V.D., Martynov N.A., Romanov E.V., Glotov A.G.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://veterinary.arriah.ru/jour/article/view/1041Введение

Введение. Актуальность данной работы обусловлена ростом антибиотикорезистентности у патогенных клостридий в агропромышленном комплексе Уральского федерального округа, что приводит к снижению эффективности терапии, увеличению экономических потерь от инфекционных заболеваний и создает угрозу межвидового переноса генов резистентности, подчеркивая необходимость разработки современных инструментов для молекулярного мониторинга в рамках реализации национальных стратегий по сдерживанию устойчивости к противомикробным препаратам.

Цель исследования

Цель исследования. Разработка и апробация ПЦР-тест-систем для детекции генов антибиотикорезистентности (tetM/B, ermB/Q, bcrA/B/D/R) у Clostridium perfringens и Clostridium difficile.

Материалы и методы

Материалы и методы. Исследовали 472 пробы биологического материала (фекалии и раневое отделяемое от животных, корма, объекты окружающей среды), отобранные в 2023–2024 гг. на 32 молочно-товарных предприятях региона. Видовую принадлежность выделенных изолятов подтверждали методом MALDI-ToF-масс-спектрометрии, а фенотипическую устойчивость к антибиотикам определяли диско-диффузионным методом в соответствии со стандартами EUCAST. С помощью ПЦР был сформирован банк ДНК, выделенной из поступивших проб биологического материала и изолятов клостридий, коллекционных штаммов различных видов спорообразующих анаэробов.

Результаты

Результаты. В результате была создана и валидирована эффективная ПЦР-панель для детекции генов антимикробной резистентности у клостридий. Скрининг 123 проб, содержащих ДНК целевых патогенов, позволил выявить распространение генов антимикробной резистентности: доминирующим у Clostridium difficile являлся ген ermB (95,1%), у Clostridium perfringens – гены ermB (90,0%) и ermQ (67,1%). Ген tetМ обнаруживали в 52,4 и 60,0% проб соответственно, гены bcrA/B/D/R – у 27,1–39,8% изолятов. Фенотипические исследования показали формирование у клостридий множественной лекарственной устойчивости.

Заключение

Заключение. Разработанная тест-система стала надежным инструментом для молекулярного мониторинга антимикробной резистентности, полученные данные свидетельствуют о массовой циркуляции клостридий с генетическим потенциалом резистентности к клинически значимым антибиотикам.

Introduction

Introduction. The rising prevalence of antibiotic resistance among pathogenic clostridia in the agro-industrial sector of the Ural Federal District highlights the need for this study. Emerging resistant strains compromise therapeutic outcomes, exacerbate economic losses attributable to infectious diseases, and pose a tangible threat of interspecies antimicrobial resistance gene transfer. These factors collectively necessitate the development of state-of-the-art molecular surveillance tools as a part of national antimicrobial resistance mitigation strategies.

Objective

Objective. The study was aimed at the development and testing of the PCR test systems for detection of antibiotic resistance genes (tetM/B, ermB/Q, bcrA/B/D/R) in Clostridium perfringens and Clostridium difficile.

Materials and methods

Materials and methods. During the study 472 biological samples (animal feces, wound discharge, feed, environmental objects) collected on 32 dairy holdings located in the region in 2023–2024 were tested. The recovered isolates’ species identity was confirmed by MALDI-ToF mass spectrometry, and the phenotypic antibiotic resistance was determined by disc diffusion method in accordance with EUCAST standards. Bank of DNAs extracted with PCR from submitted biological samples and Clostridium isolates, strains of various species of spore-forming anaerobes kept at the Microorganism Strain Collection was created.

Results

Results. Effective PCR test-kit for the detection of antibiotic resistance genes in Clostridia spp. was successfully developed and validated. Screening of 123 samples containing DNA of the target pathogens revealed a high prevalence of resistance genes: ermB gene (95.1%) was most common in Clostridium difficile, ermB (90.0%) and ermQ (67.1%) genes were predominant in Clostridium perfringens. The tetМ gene was detected in 52.4 and 60.0% of samples, respectively, while the bcrA/B/D/R genes were detected in 27.1–39.8% of isolates. Phenotypic studies confirmed the emergence of multidrug resistance in Clostridia spp.

Conclusion

Conclusion. The developed test kit has proven to be a reliable and robust tool for molecular antimicrobial resistance surveillance. The data obtained indicate a widespread circulation of Clostridium spp. harboring genetic determinants for resistance to clinically significant antibiotics.

Clostridium perfringensClostridium difficileантибиотикорезистентностьгены резистентностиПЦР-диагностикатест-системыClostridium perfringensClostridium difficileantibiotic resistanceresistance genesPCR diagnosistest-kitsРабота выполнена в рамках проекта Российского научного фонда № 23-26-00053 «Разработка тест-систем для молекулярно-генетической диагностики клостридий с идентификацией токсинотипов и генов антибиотикорезистентности» в отделе геномных исследований и селекции животных на базе Уральского научно-исследовательского ветеринарного института – структурного подразделения ФГБНУ УрФАНИЦ УрО РАН.The work was carried out within the framework of the Russian Science Foundation Project No. 23-26-00053 “Development of test systems for the molecular genetic diagnosis of Clostridium spp. with the identification of toxin types and antibiotic resistance genes” at the Department of Genomic Research and Animal Breeding on the premises of the Ural Veterinary Research Institute, a structural unit of the Ural Federal Agrarian Scientific Research Center, Ural Branch of the Russian Academy of Sciences.ReferencesСудоргина Т. Е., Глотова Т. И., Нефедченко А. В., Котенева С. В., Велькер Д. А., Глотов А. Г. Частота выделения бактерий Clostridium spp. и их ассоциаций при различных формах клостридиоза крупного рогатого скота. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки. 2024; 54 (3): 55–62. https://doi.org/10.26898/0370-8799-2024-3-6Sudorgina T. E., Glotova T. I., Nefedchenko A. V., Koteneva S. V., Velker D. A., Glotov A. G. The frequency of bacterial isolation of Clostri dium spp. and their associations in various forms of clostridiosis in cattle. Siberian Herald of Agricultural Science. 2024; 54 (3): 55–62. https://doi.org/10.26898/0370-8799-2024-3-6 (in Russ.)Нефедченко А. В., Глотова Т. И., Судоргина Т. Е. Видовой состав и токсигенные свойства клостридий крупного рогатого скота в Западно- Сибирском регионе и разработка тест-системы для их выявления. Ин новационные достижения ветеринарной науки и практики: материалы Международной научно-практической конференции, посвященной 85-летию доктора ветеринарных наук, профессора, заслуженного деятеля науки Российской Федерации Тарнуева Юрия Абогоевича (Улан-Удэ, 14–16 июля 2024 г.). Улан-Удэ: Бурятская ГСХА им. В. Р. Филиппова; 2024; 145–151. https://elibrary.ru/yvltlwNefedchenko A. V., Glotova T. I., Sudorgina T. E. Species composition and toxigenic properties of clostridium in cattle in the West Siberian region and development of a test system for their detection. Innovatsionnye dostizheniya veterinarnoi nauki i praktiki: materialy Mezhdunarodnoi nauchno-prakticheskoi konferentsii, posvyashchennoi 85-letiyu doktora veterinarnykh nauk, professora, zasluzhennogo deyatelya nauki Rossiiskoi Federatsii Tarnueva Yuriya Abogoevicha (Ulan-Udeh, 14– 16 iyulya 2024 g.) = Innovations in Veterinary Science and Practice: proceedings of the International Scientific and Practical Conference devoted to the 85th anniversary of Yury Abogoyevich Tarnuyev, Professor, Doctor of Science (Veterinary Medicine), Honored Scientist of the Russian Federation (Ulan Ude, July 14–16, 2024). Ulan-Ude: V. R. Filippov Buryat State Agricultural Academy. 2024; 145–151. https://elibrary.ru/yvltlw (in Russ.)Нефедченко А. В., Судоргина Т. Е., Глотова Т. И., Котенева С. В., Глотов А. Г. Видовая идентификация бактерий рода Clostridium, вы деленных от крупного рогатого скота, при помощи мультиплексной ПЦР в режиме реального времени. Siberian Journal of Life Sciences and Agriculture. 2025; 17 (2): 315–333. https://doi.org/10.12731/2658-6649-2025-17-2-1178Nefedchenko A. V., Sudorgina T. E., Glotova T. I., Koteneva S. V., Glotov A. G. Species identification of bacteria of the genus Clostridium isolated from cattle by multiplex real-time PCR. Siberian Journal of Life Sciences and Agriculture. 2025; 17 (2): 315–333. https://doi.org/10.12731/2658-6649-2025-17-2-1178 (in Russ.)Безбородова Н. А., Соколова О. В., Кожуховская В. B., Томских О. Г., Печура Е. В., Суздальцева М. А. Патогенные виды клостридий и их устойчивость к антибиотикам, факторы вирулентности и геномные особенности. Инновации и продовольственная безопасность. 2023; (3): 39–51. https://doi.org/10.31677/2311-0651-2023-41-3-39-51Bezborodova N. A., Sokolova O. V., Kozhukhovskaya V. V., Tomskikh O. G., Pechura E. V., Suzdal’tseva M. A. Pathogenic species of Clostridia and their antibiotic resistance, virulence factors, and genomic features. Innovations and Food Safety. 2023; (3): 39–51. https://doi.org/10.31677/2311-0651-2023-41-3-39-51 (in Russ.)Безбородова Н. А., Порываева А. П., Шилова Е. Н., Кожуховская В. В., Соколова О. В., Яцентюк С. П. Оценка эффективности вакцин против клостридиозов крупного рогатого скота, с учетом доминирующих анаэробных возбудителей на территории Свердловской области. Ветеринария Кубани. 2025; (1): 4–7. https://elibrary.ru/jugmezBezborodova N. A., Poryvaeva A. P., Shilova E. N., Kozhukhovskaya V. V., Sokolova O. V., Yatsentyuk S. P. Evaluation of the efficiency of vaccines against bovine clostridiosis, taking into account the dominant anaerobic pathogens in Sverdlovsk region. Veterinaria Kubani. 2025; (1): 4–7. https://elibrary.ru/jugmez (in Russ.)Андреева С. В., Шадрова Н. Б., Скитович Г. С. Методические рекомендации по идентификации микроорганизмов с применением масс-спектрометра MALDI-ToF Autof MS 1000: утв. ФГБУ «ВНИИЗЖ» 23.06.2023 № 44-23. Владимир; 2023. 43 с.Andreeva S. V., Shadrova N. B., Skitovich G. S. Methodical guidelines for microorganism identification with MALDI-ToF Autof MS 1000 mass spectrometer: approved by the Federal Centre for Animal Health, on 23 June 2023 No. 44-23. Vladimir; 2023. 43 p. (in Russ.)Bendary M. M., Abd El-Hamid M. I., El-Tarabili R. M., Hefny A. A., Algendy R. M., Elzohairy N. A., et al. Clostridium perfringens associated with foodborne infections of animal origins: insights into prevalence, antimicrobial resistance, toxin genes profiles, and toxinotypes. Biology. 2022; 11 (4):551. https://doi.org/10.3390/biology11040551Bendary M. M., Abd El-Hamid M. I., El-Tarabili R. M., Hefny A. A., Algendy R. M., Elzohairy N. A., et al. Clostridium perfringens associated with foodborne infections of animal origins: insights into prevalence, antimicrobial resistance, toxin genes profiles, and toxinotypes. Biology. 2022; 11 (4):551. https://doi.org/10.3390/biology11040551Hassani S., Pakbin B., Brück W. M., Mahmoudi R., Mousavi S. Prevalence, antibiotic resistance, toxin-typing and genotyping of Clostridium perfringens in raw beef meats obtained from Qazvin City, Iran. Antibiotics. 2022; 11 (3):340. https://doi.org/10.3390/antibiotics11030340Hassani S., Pakbin B., Brück W. M., Mahmoudi R., Mousavi S. Prevalence, antibiotic resistance, toxin-typing and genotyping of Clostridium perfringens in raw beef meats obtained from Qazvin City, Iran. Antibiotics. 2022; 11 (3):340. https://doi.org/10.3390/antibiotics11030340МУК 4.2.1890-04 Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам: методические указания. М.: Федеральный центр госсанэпиднадзора Минздрава России; 2004. 91 с. 10. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 10.0. 2020. https://www.eucast.org/fileadmin/src/media/PDFs/EUCAST_files/Breakpoint_tables/v_10.0_Breakpoint_Tables.pdfMG 4.2.1890-04 Testing of microorganisms for susceptibility to antimicrobials: methodical guidelines. Moscow: Federal Center for State Sanitary and Epidemiological Surveillance (Russian Ministry of Health); 2004. 91 p. (in Russ.)Adams V., Han X., Lyras D., Rood J. I. Antibiotic resistance plasmids and mobile genetic elements of Clostridium perfringens. Plasmid. 2018; 99: 32–39. https://doi.org/10.1016/j.plasmid.2018.07.002The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 10.0. 2020. https://www.eucast.org/fileadmin/src/media/PDFs/EUCAST_files/Breakpoint_tables/v_10.0_Breakpoint_Tables.pdfAnju K., Karthik K., Divya V., Mala Priyadharshini M. L., Sharma R. K., Manoharan S. Toxinotyping and molecular characterization of antimicrobial resistance in Clostridium perfringens isolated from different sources of livestock and poultry. Anaerobe. 2021; 67:102298. https://doi.org/10.1016/j.anaerobe.2020.102298Adams V., Han X., Lyras D., Rood J. I. Antibiotic resistance plasmids and mobile genetic elements of Clostridium perfringens. Plasmid. 2018; 99: 32–39. https://doi.org/10.1016/j.plasmid.2018.07.002Holt H. M., Danielsen T. K., Justesen U. S. Routine disc diffusion antimicrobial susceptibility testing of Clostridium difficile and association with PCR ribotype 027. European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. 2015; 34 (11): 2243–2246. https://doi.org/10.1007/s10096-015-2475-xAnju K., Karthik K., Divya V., Mala Priyadharshini M. L., Sharma R. K., Manoharan S. Toxinotyping and molecular characterization of antimicrobial resistance in Clostridium perfringens isolated from different sources of livestock and poultry. Anaerobe. 2021; 67:102298. https://doi.org/10.1016/j.anaerobe.2020.102298Huang H., Weintraub A., Fang H., Wu S., Zhang Y., Nord C. E. Antimicrobial susceptibility and heteroresistance in Chinese Clostridium difficile strains. Anaerobe. 2010; 16 (6): 633–635. https://doi.org/10.1016/j.anaerobe.2010.09.002Holt H. M., Danielsen T. K., Justesen U. S. Routine disc diffusion antimicrobial susceptibility testing of Clostridium difficile and association with PCR ribotype 027. European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. 2015; 34 (11): 2243–2246. https://doi.org/10.1007/s10096-015-2475-xImwattana K., Rodríguez C., Riley T. V., Knight D. R. A species-wide genetic atlas of antimicrobial resistance in Clostridioides difficile. Microbial Genomics. 2021; 7 (11):000696. https://doi.org/10.1099/mgen.0.000696Huang H., Weintraub A., Fang H., Wu S., Zhang Y., Nord C. E. Antimicrobial susceptibility and heteroresistance in Chinese Clostridium difficile strains. Anaerobe. 2010; 16 (6): 633–635. https://doi.org/10.1016/j.anaerobe.2010.09.002Untergasser A., Cutcutache I., Koressaar T., Ye J., Faircloth B. C., Remm M., Rozen S. G. Primer3 – new capabilities and interfaces. Nucleic Acids Research. 2012; 40 (15):e115. https://doi.org/10.1093/nar/gks596Imwattana K., Rodríguez C., Riley T. V., Knight D. R. A species-wide genetic atlas of antimicrobial resistance in Clostridioides difficile. Microbial Genomics. 2021; 7 (11):000696. https://doi.org/10.1099/mgen.0.000696Rodríguez A., Rodríguez M., Córdoba J. J., Andrade M. J. Design of Primers and Probes for Quantitative Real-Time PCR Methods. In: PCR Primer Design. Methods in Molecular Biology Methods in Molecular Biology. Vol. 1275. Ed. by C. Basu. New York: Humana Press; 2015; Chapter 3: 31–56. https://doi.org/10.1007/978-1-4939-2365-6_3Untergasser A., Cutcutache I., Koressaar T., Ye J., Faircloth B. C., Remm M., Rozen S. G. Primer3 – new capabilities and interfaces. Nucleic Acids Research. 2012; 40 (15):e115. https://doi.org/10.1093/nar/gks596Schmidt C., Löffler B., Ackermann G. Antimicrobial phenotypes and molecular basis in clinical strains of Clostridium difficile. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. 2007; 59 (1): 1–5. https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2007.03.009Rodríguez A., Rodríguez M., Córdoba J. J., Andrade M. J. Design of Primers and Probes for Quantitative Real-Time PCR Methods. In: PCR Primer Design. Methods in Molecular Biology Methods in Molecular Biology. Vol. 1275. Ed. by C. Basu. New York: Humana Press; 2015; Chapter 3: 31–56. https://doi.org/10.1007/978-1-4939-2365-6_3Spigaglia P., Mastrantonio P. Comparative analysis of Clostridium difficile clinical isolates belonging to different genetic lineages and time periods. Journal of Medical Microbiology. 2004; 53 (11): 1129–1136. https://doi.org/10.1099/jmm.0.45682-0Schmidt C., Löffler B., Ackermann G. Antimicrobial phenotypes and molecular basis in clinical strains of Clostridium difficile. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. 2007; 59 (1): 1–5. https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2007.03.009Bendary M. M., Abd El-Hamid M. I., El-Tarabili R. M., Hefny A. A., Algendy R. M., Elzohairy N. A., et al. Clostridium perfringens associated with foodborne infections of animal origins: insights into prevalence, antimicrobial resistance, toxin genes profiles, and toxinotypes. Biology. 2022; 11 (4):551. https://doi.org/10.3390/biology11040551Spigaglia P., Mastrantonio P. Comparative analysis of Clostridium difficile clinical isolates belonging to different genetic lineages and time periods. Journal of Medical Microbiology. 2004; 53 (11): 1129–1136. https://doi.org/10.1099/jmm.0.45682-0Kartalidis P., Skoulakis A., Tsilipounidaki K., Florou Z., Petinaki E., Fthenakis G. C. Clostridioides difficile as a dynamic vehicle for the dissemination of antimicrobial-resistance determinants: review and in silico analysis. Microorganisms. 2021; 9 (7):1383. https://doi.org/10.3390/microorganisms9071383Bendary M. M., Abd El-Hamid M. I., El-Tarabili R. M., Hefny A. A., Algendy R. M., Elzohairy N. A., et al. Clostridium perfringens associated with foodborne infections of animal origins: insights into prevalence, antimicrobial resistance, toxin genes profiles, and toxinotypes. Biology. 2022; 11 (4):551. https://doi.org/10.3390/biology11040551Pannullo A. G., Zbylicki B. R., Ellermeier C. D. Identification of DraRS in Clostridioides difficile, a two-component regulatory system that responds to lipid II-interacting antibiotics. Journal of Bacteriology. 2023; 205 (10):e00164-23. https://doi.org/10.1128/jb.00164-23Kartalidis P., Skoulakis A., Tsilipounidaki K., Florou Z., Petinaki E., Fthenakis G. C. Clostridioides difficile as a dynamic vehicle for the dissemination of antimicrobial-resistance determinants: review and in silico analysis. Microorganisms. 2021; 9 (7):1383. https://doi.org/10.3390/microorganisms9071383Ho T. D., Ellermeier C. D. PrsW is required for colonization, resistance to antimicrobial peptides, and expression of extracytoplasmic function σ factors in Clostridium difficile. Infection and Immunity. 2011; 79 (8): 3229 3238. https://doi.org/10.1128/iai.00019-11Pannullo A. G., Zbylicki B. R., Ellermeier C. D. Identification of DraRS in Clostridioides difficile, a two-component regulatory system that responds to lipid II-interacting antibiotics. Journal of Bacteriology. 2023; 205 (10):e00164-23. https://doi.org/10.1128/jb.00164-23Kather E. J., Marks S. L., Foley J. E. Determination of the prevalence of antimicrobial resistance genes in canine Clostridium perfringens isolates. Veterinary Microbiology. 2006; 113 (1–2): 97–101. https://doi.org/10.1016/j.vetmic.2005.10.021Ho T. D., Ellermeier C. D. PrsW is required for colonization, resistance to antimicrobial peptides, and expression of extracytoplasmic function σ factors in Clostridium difficile. Infection and Immunity. 2011; 79 (8): 3229 3238. https://doi.org/10.1128/iai.00019-11Kather E. J., Marks S. L., Foley J. E. Determination of the prevalence of antimicrobial resistance genes in canine Clostridium perfringens isolates. Veterinary Microbiology. 2006; 113 (1–2): 97–101. https://doi.org/10.1016/j.vetmic.2005.10.021Kather E. J., Marks S. L., Foley J. E. Determination of the prevalence of antimicrobial resistance genes in canine Clostridium perfringens isolates. Veterinary Microbiology. 2006; 113 (1–2): 97–101. https://doi.org/10.1016/j.vetmic.2005.10.021

The authors declare that there are no conflicts of interest present.